1、隨著水稻和玉米雜種優(yōu)勢的充分利用，為作物生產(chǎn)帶來了可觀的經(jīng)濟(jì)效益，而在雜種優(yōu)勢利用較困難的大豆上，因其單產(chǎn)水平較低使其總體生產(chǎn)形勢非常嚴(yán)峻，所以迫切需要實(shí)現(xiàn)大豆的高產(chǎn)育種；首要工作就是要發(fā)掘產(chǎn)量性狀的優(yōu)異基因。然而，只研究產(chǎn)量這一個(gè)性狀往往不能解決根本性問題，這就需要考察與產(chǎn)量相關(guān)的多個(gè)性狀，以準(zhǔn)確分析影響產(chǎn)量的各種因素，以便為高產(chǎn)育種提供更準(zhǔn)確的信息。栽培大豆是起源于我國的重要油料作物，有著豐富的品種資源，這為實(shí)現(xiàn)高產(chǎn)育種提供了堅(jiān)實(shí)的

2、材料基礎(chǔ)。對大豆種質(zhì)資源的利用，關(guān)聯(lián)分析是近幾年來逐步發(fā)展起來的新途徑，能找到與性狀直接關(guān)聯(lián)的標(biāo)記；但是，當(dāng)前關(guān)聯(lián)分析在大豆種質(zhì)資源的利用研究上往往采用假陽性率較高的單標(biāo)記方法。
　　 本研究以分層隨機(jī)抽樣方法抽取的215份大豆品種為研究材料，利用135個(gè)SSR標(biāo)記的多態(tài)性數(shù)據(jù)剖析了該品種群體的遺傳特征，包括群體遺傳結(jié)構(gòu)、遺傳多樣性和連鎖不平衡性；在對主要農(nóng)藝性狀的表型變異參數(shù)進(jìn)行分析后，運(yùn)用TASSEL軟件和E-BAYES方法

3、對主要農(nóng)藝性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，挖掘了優(yōu)異等位變異并找到了相應(yīng)的典型載體材料；最后，初步預(yù)測了改良主要農(nóng)藝性狀的優(yōu)異雜交組合。得到的主要結(jié)果有：
　　 1、利用STRUCTURE、PowerMarker和地理生態(tài)類型三種方法進(jìn)行群體遺傳結(jié)構(gòu)剖分，分別將大豆群體分成了4、3和6個(gè)亞群。對三種分類方法亞群間以及亞群內(nèi)的參數(shù)估算得到，STRUCTURE分組得到的亞群間成對Fst值最大，為0.1083；亞群間含有相同最高頻率等位基因的位點(diǎn)數(shù)

4、最小，為85;亞群內(nèi)基因多樣性、多態(tài)性信息含量、等位基因個(gè)數(shù)、群體內(nèi)分化系數(shù)以及群體內(nèi)遺傳多樣性Hs均最小。這表明STRUCTURE軟件能更好地剖分群體的遺傳結(jié)構(gòu)。
　　 遺傳多樣性分析中，135個(gè)SSR標(biāo)記共產(chǎn)生了890個(gè)等位基因；平均每個(gè)位點(diǎn)的有效等位基因數(shù)Ae、多態(tài)性信息含量PIC、基因多樣性和觀測雜合度Ho分別為3.46、0.5140、0.5540和0.013。STRUCTURE分組的第三亞群的各個(gè)群體遺傳統(tǒng)計(jì)量在所有亞

5、群中最高，表明該亞群遺傳多樣性最豐富。TASSEL進(jìn)行的連鎖不平衡性分析得到：1）22.49％的位點(diǎn)對存在LD，共線性和非共線性位點(diǎn)對中存在LD的分別占34.16％和21.88％;2）整體分析和亞群獨(dú)立分析中共線性和非共線性LD位點(diǎn)對的D′集中于0.2-0.4, r2集中于0-0.2;3）當(dāng)標(biāo)記間遺傳距離＞20cM時(shí)，整個(gè)群體和亞群的LD程度的衰減趨勢均不明顯。
　　 2、利用E-BAYES方法和TASSEL軟件，在株高、主莖節(jié)

6、數(shù)、分枝數(shù)、粒莖比、莖粗、表觀收獲指數(shù)和全生育期性狀中分別檢測到38個(gè)和177個(gè)主效QTL,其中共同的主效QTL有26個(gè)。E-BAYES方法檢測到的主效標(biāo)記的LOD值范圍為2.54～77.36，遺傳率范圍為0.02～0.25，總共解釋的各性狀遺傳率分別達(dá)到18％、40％、42％、36％、39％、46％和39％。利用E-BAYES方法在株高、主莖節(jié)數(shù)、分枝數(shù)、莖粗、表觀收獲指數(shù)和全生育期性狀中還檢測到177個(gè)互作，其中40個(gè)標(biāo)記出現(xiàn)在TA

7、SSEL檢測的主效標(biāo)記中；總共解釋的遺傳率分別為81.67％、59.51％、58.44％、53.69％、54.42％和61.46％.
　　 對優(yōu)異等位變異的發(fā)掘和典型載體材料的搜索發(fā)現(xiàn)：satt440(179bp)和satt440(251bp)、satt632(305bp)和satt160(285bp)、sat_267(223bp)和satt244(177/165bp)、satt354(300bp)和satt354(309bp)

8、、sat_267(287/255bp)和satt352(181bp)、satt514(299bp)和sat_267(255/231bp)分別是株高、主莖節(jié)數(shù)、分枝數(shù)、莖粗、表觀收獲指數(shù)、全生育期中增效和減效效應(yīng)最大的等位變異類型，攜帶各性狀增效和減效效應(yīng)最大的優(yōu)異等位變異類型的代表性載體材料分別是湖南秋豆1號(hào)和誘變790、晉豆2號(hào)和淮黃1號(hào)、合肥兩塘焦雙青豆和嘉善紅毛莢、田岸豆和齊588-8、勤研1號(hào)和長汀細(xì)豆、平果黃豆和文豐6號(hào)；粒莖

9、比中，satt382(295bp)和satt382(325bp)、satt683(224bp)分別是增效和減效效應(yīng)最大的等位變異，代表性載體材料分別是勤研1號(hào)和八月青、皖豆1號(hào)。
　　 3、對優(yōu)異雜交組合預(yù)測的結(jié)果發(fā)現(xiàn)，尉青豆、融豆21、科系8號(hào)和武義青豆、嘉祥牛毛黃、大粒黃豆則分別對性狀株高、主莖節(jié)數(shù)、分枝數(shù)、莖粗、全生育期具有改良的作用。在這些組合中，發(fā)現(xiàn)一些品種可同時(shí)改良多個(gè)性狀，如勤研1號(hào)可以同時(shí)改良性狀粒莖比和表觀收獲