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![基于SSR標記的金針菇若干重要性狀的關聯分析.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/8/d8816abc-33d7-430e-8390-c546abb40736/d8816abc-33d7-430e-8390-c546abb407361.gif)
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文檔簡介
1、金針菇作為我國主要的食用菌栽培品種之一,也是我國工廠化生產發(fā)展最快的栽培食用菌,產量居于世界上第四位,具有重要的商業(yè)價值。金針菇分布廣泛,種質資源豐富,給金針菇遺傳育種提供了豐富的親本材料。金針菇的原基期、單瓶產量等農藝性狀是具有連續(xù)變異特性的數量性狀,遺傳機制復雜,也是金針菇育種工作中的重要目標性狀。分子標記能直觀反映基因型特點,通過分子標記與農藝性狀關聯定位改良性狀已成功運用在很多物種上,但金針菇的關聯定位工作仍處于起步階段。利用分
2、子標記技術結合數量性狀的數據,以連鎖不平衡為基礎的關聯分析方法進行金針菇數量性狀的遺傳研究,給金針菇選育優(yōu)良新品種提供了新的思路。
本研究選擇保藏于上海市農業(yè)科學院食用菌所的源自不同國家和地區(qū)的90個金針菇菌株為研究材料,通過液體培養(yǎng)菌種,工廠化條件下進行栽培試驗,探究了金針菇的原基期、菌柄長度、菌柄直徑、菌蓋直徑、單瓶產量之間的相關程度。在依據金針菇Dan3測序結果設計合成的SSR引物中篩選到95個具有多態(tài)性的標記,對材料的
3、遺傳多樣性和群體結構進行了分析。結合上述各個性狀的表型數據,通過基于連鎖不平衡的關聯分析方法,進行了性狀與標記的關聯分析研究,旨在發(fā)掘與農藝性狀相關聯的位點。主要結果如下:
1.金針菇的原基期、菌柄長度、菌柄直徑、菌蓋直徑、單瓶產量相關分析結果表明:單瓶產量的變異最大,原基期的變異最小。菌柄長度與原基期、單瓶產量成極顯著正相關,與菌蓋直徑顯著相關;而菌柄直徑與菌蓋直徑成極顯著相關。即金針菇各個性狀之間的相關性較小,部分性狀并不
4、相關。
2. SSR標記等位變異豐富,95個SSR引物在供試菌株中共檢測到582個等位變異,單位點等位變異變化范圍為3~13個,平均為6.13個。各位點多態(tài)信息(PIC)含量變化范圍為0.204~0.818,平均為0.542;SSR遺傳相似系數介于0.605~0.995,平均為0.785。本研究供試的90個金針菇菌株來源廣泛,地理差異大,菌株間具有豐富的遺傳多樣性?;赨PGMA的聚類分析將90株金針菇分為4大類群,群體結構分
5、析將供試菌株劃分為8個亞群,但兩者劃分結果具有很高的一致性。
3.95個SSR標記位點產生的4465個組合位點的連鎖不平衡分布結果表明:在共線性和非共線性的SSR位點間都存在一定程度的LD。統(tǒng)計概率(p<0.01)支持的不平衡成對位點總位點組合數的78.72%,其中統(tǒng)計測驗概率為0.001顯著水平的不平衡成對位點占總位點組合數的72.92%;連鎖不平衡程度D'>0.5的組合數占總位點組合數的33.01%。
4.通過T
6、ASEEL軟件中一般線性模型對個5個農藝形狀與95個SSR分子標記關聯分析結果表明:共檢測到7個與3個性狀顯著關聯的位點,其中與菌柄直徑顯著相關聯的位點有4個,分別為119、122、171、186,其表型變異解釋率依次為23.02%、21.86%、16.47%、22.02%;與單瓶產量顯著相關聯的位點有2個,分別為99、171,其表型變異解釋率依次為18.94%、18.14%;與菌柄長度顯著相關聯的位點有2個,分別為65、195,其表型
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