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1、miRNA是內(nèi)源的非編碼小RNA,主要長(zhǎng)度在18nt-25nt,在轉(zhuǎn)錄水平上抑制翻譯或者降解靶基因來(lái)調(diào)控mRNA的表達(dá)。miRNA在植物和動(dòng)物基因的表達(dá)中都起到重要的調(diào)控作用(Unver et al.,2009),在植物中,miRNA主要與生長(zhǎng)發(fā)育(David et al.,2004)、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)(Jones et al.,2006)、蛋白降解(Chen et al.,2005)和抑制環(huán)境脅迫、病菌侵染(Zhang et al.,2006
2、)等有關(guān)。
隨著蘋果栽培品種的不斷更新,富士蘋果已經(jīng)成為我國(guó)的主要栽培品種。在我國(guó)蘋果的主要產(chǎn)區(qū),每年由于各種病害的發(fā)生,導(dǎo)致蘋果產(chǎn)業(yè)遭受了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。蘋果輪紋病(Apple ring rot)是當(dāng)前蘋果生產(chǎn)上最嚴(yán)重的病害之一,而目前的主栽品種富士蘋果是蘋果輪紋病的易感品種。湖北海棠是一種重要的蘋果砧木,對(duì)蘋果輪紋病有較好的抗性。比較感病品種富士蘋果和抗病品種湖北海棠的miRNA,對(duì)于研究和提高主栽品種富士蘋果對(duì)蘋果輪紋病
3、的抗性有著重要的意義。
主要研究成果如下:
1.通過高通量測(cè)序富士蘋果未經(jīng)處理的莖,我們發(fā)現(xiàn)了165個(gè)miRNA屬于49個(gè)miRNA家族,對(duì)這些已知家族的miRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),預(yù)測(cè)結(jié)果表明靶基因大多編碼轉(zhuǎn)錄蛋白,這一結(jié)果與其他植物中的研究結(jié)果相類似。此外,我們還預(yù)測(cè)了380個(gè)新的候選miRNA,并用半定量PCR檢測(cè)了其在莖和葉中的表達(dá),發(fā)現(xiàn)其表達(dá)具有組織器官的特異性。本研究發(fā)現(xiàn)的已知家族的miRNA和新的候選mi
4、RNA在進(jìn)一步研究富士蘋果生長(zhǎng)發(fā)育中起著重要作用。
2.通過高通量測(cè)序湖北海棠未經(jīng)處理的莖,發(fā)現(xiàn)165個(gè)miRNA屬于52個(gè)miRNA家族,對(duì)這些已知家族的miRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),預(yù)測(cè)結(jié)果表明靶基因大多編碼轉(zhuǎn)錄蛋白,這一結(jié)果與其他植物中的研究類似。此外,我們還預(yù)測(cè)了821個(gè)新的候選miRNA,并用半定量PCR檢測(cè)了表達(dá)量高的新候選miRNA在莖和葉中的表達(dá)差異,發(fā)現(xiàn)其表達(dá)具有組織器官的特異性。本研究發(fā)現(xiàn)的已知家族的miRNA
5、和新的候選miRNA為研究湖北海棠收集、保存、評(píng)價(jià)和利用提供了科學(xué)依據(jù)。
3.通過高通量測(cè)序比較蘋果輪紋病抗性不同品種富士蘋果和湖北海棠中的miRNA,發(fā)現(xiàn)了11個(gè)差異表達(dá)的miRNA,與富士比其中湖北海棠9個(gè)miRNA是上調(diào)表達(dá)的,2個(gè)miRNA是下調(diào)表達(dá)的,分析了miRNA靶基因的功能,發(fā)現(xiàn)與植物逆境脅迫相關(guān),這表明這些miRNA可能與蘋果輪紋病抗性相關(guān)的。對(duì)進(jìn)一步提高主要栽培品種富士蘋果抵抗蘋果輪紋病具有重要的意義。
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