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![稻飛虱兩種sdRNA傳導(dǎo)相關(guān)基因克隆與功能研究.pdf_第1頁(yè)](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/9/dfb5112a-382f-453d-8ba3-0f10591faf40/dfb5112a-382f-453d-8ba3-0f10591faf401.gif)
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1、RNAi是指由內(nèi)源性或外源性雙鏈RNA(double-stranded RNA,dsRNA)介導(dǎo)的細(xì)胞內(nèi)mRNA發(fā)生特異性降解,導(dǎo)致靶基因的表達(dá)沉默,產(chǎn)生相應(yīng)的功能表型缺失。
灰飛虱Laodelphax striatellus(Fallen)和褐飛虱Nilaparvata lugens(stal)同屬于半翅目(Hemiptera)蟬亞目(Cicadomorpha)蠟蟬總科(Fulgoroidea)中的飛虱科(Delphac
2、idae),都是全球性糧食作物的重要害蟲(chóng),不僅能刺吸為害而且還能傳播病毒。對(duì)稻飛虱的防治主要以化學(xué)農(nóng)藥防治為主,不但造成了嚴(yán)重的環(huán)境污染,破壞生態(tài)平衡,使農(nóng)藥殘留增大,對(duì)人和其它動(dòng)物健康構(gòu)成威脅。因此,需要更清潔安全的防治技術(shù)替代傳統(tǒng)技術(shù)。近幾年,越來(lái)越多的學(xué)者將RNAi技術(shù)應(yīng)用于稻飛虱,試圖開(kāi)發(fā)新的防治途徑。
dsRNA的傳導(dǎo)是引發(fā)RNAi的關(guān)鍵一環(huán),本研究基于國(guó)內(nèi)外對(duì)dsRNA傳導(dǎo)的研究,以兩種稻飛虱的sid和chc同
3、源基因?yàn)檠芯繉?duì)象,在活體昆蟲(chóng)中驗(yàn)證兩種基因與dsRNA傳導(dǎo)的關(guān)系,以便尋找切實(shí)可行的提高RNAi效應(yīng)的途徑,為在昆蟲(chóng)研究領(lǐng)域更好的應(yīng)用RNAi技術(shù)提供依據(jù)。
現(xiàn)將主要研究結(jié)果總結(jié)如下:
1、灰飛虱sid-1-like基因和網(wǎng)格蛋白重鏈基因全長(zhǎng)克隆
本研究首先利用灰飛虱轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)篩選網(wǎng)格蛋白重鏈(Clathrin heavy chain,Chc)和sid-1-like的基因,獲得相關(guān)基因片段后進(jìn)行
4、克隆驗(yàn)證,并設(shè)計(jì)特異性引物,采用RACE技術(shù)進(jìn)行基因全長(zhǎng)克隆,利用序列分析軟件對(duì)全長(zhǎng)序列進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,克隆chc基因得到的序列長(zhǎng)度為5,347bp,ORF編碼961個(gè)氨基酸,編碼的蛋白分子量為110.1078kD,PI為5.36,且具有clathrin7-fold repeat特征區(qū)域,聚類分析顯示與不同生物Chc基因同源,與其它昆蟲(chóng)Chc聚為一大類,相似度達(dá)92%以上。克隆sid-1-like基因獲得的序列全長(zhǎng)為2,515bp
5、bp,ORF編碼648個(gè)氨基酸,所編碼的蛋白分子量為52.0588kD,PI為8.98,通過(guò)氨基酸拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析可知克隆的基因與線蟲(chóng)和棉蚜sid-1同源基因的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)具有極高的相似性,并都具有11個(gè)跨膜區(qū)域等sid-1-like基因的特征,聚類分析顯示與不同生物sid-1-like基因同源,相似度在22%至81%之間,其中與近緣種褐飛虱的sid-1-like基因相似性最高,達(dá)到81%。由此認(rèn)為所克隆的序列全長(zhǎng)分別是灰飛虱的Chc同源基因和
6、sid-1-like基因,被分別命名為L(zhǎng)schc和Lssid。該研究為設(shè)計(jì)dsRNA,利用RNAi深入研究其功能,以及在灰飛虱RNAi中的作用,奠定了基礎(chǔ)。
2、沉默灰飛虱sid-1-like基因和灰飛虱網(wǎng)格蛋白重鏈基因?qū)绎w虱RNAi的影響
本研究以灰飛虱幾丁質(zhì)合成酶基因(Lschi)為報(bào)告基因,通過(guò)兩次RNAi手段,測(cè)定干擾灰飛虱chc和sid-1-like基因是否影響dschi對(duì)灰飛虱網(wǎng)格蛋白重鏈基因的
7、干擾作用。結(jié)果表明,單獨(dú)喂食dssid及dschc對(duì)灰飛虱的死亡率(5.25%和3.98%)和chi基因的相對(duì)表達(dá)水平(1.33和1.19)沒(méi)有顯著影響,與喂食dsEGFP的對(duì)照處理(5.07%;1.0)沒(méi)有顯著差異。表明單獨(dú)干擾sid和chc不會(huì)影響灰飛虱chi基因的表達(dá),也不會(huì)影響試蟲(chóng)的死亡率變化。但單獨(dú)喂食dschi可以顯著抑制灰飛虱chi基因的表達(dá),其表達(dá)水平僅有對(duì)照的40%,同時(shí)導(dǎo)致試蟲(chóng)死亡率顯著升高(22.78%),是dsG
8、FP處理的4.6倍。將dschi與dssid或/和dschc混合喂食處理時(shí),dschi對(duì)chi基因表達(dá)的抑制作用以及對(duì)試蟲(chóng)的致死效應(yīng),均大幅下降。喂食dssid+dschi、dschc+dschi及dssid+dschc+dschi混合dsRNA的chi基因相對(duì)表達(dá)量沒(méi)有顯著差異,分別為0.77、0.64和0.81,但顯著高于dschi單獨(dú)處理而低于對(duì)照處理。檢測(cè)試蟲(chóng)的死亡率也得到類似結(jié)果,即3種混合處理之間沒(méi)有顯著差異,4d累積死亡率
9、分別為,6.65%、6.61%和7.43%,但顯著低于dschi處理(22.78%)高于dsGFP處理(5.07%)。此外,試驗(yàn)還發(fā)現(xiàn)調(diào)整dssid+dschc+dschi的混合比例對(duì)干擾效果沒(méi)有顯著影響。顯然干擾sid和chc均會(huì)顯著影響灰飛虱體內(nèi)的RNAi,且兩者表現(xiàn)的抑制效應(yīng)相當(dāng)。由此表明sid和chc均是灰飛虱體內(nèi)RNAi的重要功能基因。
3、沉默褐飛虱sid-1-like和褐飛虱網(wǎng)格蛋白重鏈基因?qū)诛w虱RNAi的
10、影響
本研究以褐飛虱幾丁質(zhì)合成酶(Nlchi)為報(bào)告基因,通過(guò)兩次RNAi手段,測(cè)定了干擾褐飛虱chc和sid基因是否影響dschi對(duì)Nlchi基因的干擾作用。結(jié)果表明,單獨(dú)喂食dssid(8.05%),和單獨(dú)喂食dschc(15.30%)的死亡率,均顯著高于單獨(dú)喂食dsEGFP的死亡率(2.84%),而兩處理對(duì)Nlchi基因的表達(dá)水平(1.09和1.26)沒(méi)有顯著影響,與喂食dsEGFP的(1.21)沒(méi)有顯著差異。表明單
11、獨(dú)干擾褐飛虱sid-1-like和褐飛虱網(wǎng)格蛋白重鏈不會(huì)影響Nlchi基因的表達(dá),但對(duì)試蟲(chóng)的有一定的致死效應(yīng)。單獨(dú)喂食dschi可以顯著抑制Nlchi基因的表達(dá),其表達(dá)水平(0.33)僅有對(duì)照的33%,同時(shí)導(dǎo)致試蟲(chóng)死亡率顯著升高(28.29%),是dsEGFP處理的14倍。將dschi與dssid或/和dschc混合喂食處理時(shí),dschi對(duì)Nlchi基因表達(dá)的抑制作用以及對(duì)試蟲(chóng)的致死效應(yīng),均大幅下降。喂食dssid+dschi、dsch
12、c+dschi及dssid+dschc+dschi混合dsRNA4d累積死亡率分別為,16.07%、19.63%和19.65%,處理間無(wú)顯著差異,但顯著低于dschi處理(28.29%)高于dsEGFP處理(2.84%)。檢測(cè)三處理的Nlchi基因相對(duì)表達(dá)量沒(méi)有顯著差異,分別為1.06、0.77和1.14,但顯著高于dschi單獨(dú)處理(0.33)而低于對(duì)照處理。證實(shí)干擾Nlsid和Nlchc均會(huì)顯著影響褐飛虱體內(nèi)的RNAi,且干擾Nls
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