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![水稻T-DNA插入葉綠素缺失突變體篩選及側(cè)翼序列分離.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/9/a0a3ae72-b485-47da-b2d4-989d97686ebc/a0a3ae72-b485-47da-b2d4-989d97686ebc1.gif)
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文檔簡介
1、本研究是在建立了水稻(Orza sativa)大規(guī)模T-DNA插入突變體庫的基礎(chǔ)上,開展的關(guān)于水稻葉綠素缺失突變體篩選工作。葉綠素缺失突變體是在篩選水稻T-DNA插入突變體過程中得到最多,也是性狀明確、最易判定的一類突變體。由于該類突變體葉綠體發(fā)育大多受到不同程度的影響,而造成光合作用的改變,因此這類突變體不但是研究葉綠素合成與降解,而且也是研究光合作用的基礎(chǔ)材料。本研究通過對苗期葉綠素缺失突變體的篩選,在獲得葉綠素缺失突變的基礎(chǔ)上,開
2、展了對突變體的鑒定以及T-DNA插入位點側(cè)翼序列分離的工作;并且在獲得側(cè)翼序列的基礎(chǔ)上,探討了T-DNA插入位點附近序列的結(jié)構(gòu);最后,對T-DNA插入所標(biāo)記的基因做了預(yù)測和PCR共分離驗證,確定了造成葉綠素缺失性狀的候選基因;為最終驗證候選基因的生物學(xué)功能,試驗并建立了互補轉(zhuǎn)化的組織培養(yǎng)體系。本研究所獲得的具體實驗結(jié)果如下: 1、通過對大約10,000份水稻品種日本晴(Japonica rice cv. Nipponbare)T
3、-DNA插入增強子捕獲突變體庫葉綠素缺失突變體的篩選,共得到430個葉綠素缺失突變株系,在對突變株系GUS染色后,共檢測到34個GUS表達(dá)為陽性的株系,并且9個株系的突變表型與GUS染色共分離。 2、利用PCR-walking技術(shù)分離了突變株的T-DNA插入位點側(cè)翼序列。分離過程中分別使用了DraI、EcoRV、SspI限制性內(nèi)切酶,在9個突變株系中共擴增獲得10條序列,其中在株系A(chǔ)401中擴得2條序列,其它株系各1條。經(jīng)過對所
4、獲得序列測序,在10個序列中,6個序列包含水稻基因組DNA,另外4個序列可能由于T-DNA左邊界通讀或者不明原因的測序終止,而不包含水稻序列,全部為增強子捕獲載體(pFX-E24.2-15R)的載體骨架。 3、通過對T-DNA插入位點左側(cè)側(cè)翼序列的分析發(fā)現(xiàn),在10個序列中,有8個序列獲得了關(guān)于T-DNA左邊界附近序列的信息,其它2個由于沒有測至LB,而沒有得到相關(guān)信息。在這8個序列中,7個都發(fā)生了T-DNA左邊界整合過程中不同程
5、度的的缺失現(xiàn)象,其中1個缺失程度甚至達(dá)到了130bp。除T-DNA左邊界序列缺失現(xiàn)象外,還發(fā)現(xiàn)2例不明來源序列的填充現(xiàn)象。另外常見的邊界通讀和T-DNA多拷貝重復(fù)現(xiàn)象也在本研究中發(fā)現(xiàn)。 4、經(jīng)過同源性搜索,6個含水稻基因組DNA的序列中,有4個位于基因的內(nèi)部,其余2個位于基因間。之后經(jīng)過PCR共分離驗證,在被T-DNA插入標(biāo)記的4個基因中,確定3個基因與突變表型共分離,這3個基因分別是:被預(yù)測編碼產(chǎn)物定位于葉綠體的GTP-bin
6、ding基因,該基因編碼產(chǎn)物可能參與葉綠體核糖體組裝;編碼產(chǎn)物定位于線粒體的絲氨酸羥甲基轉(zhuǎn)移酶(SHMT)基因,絲氨酸羥甲基轉(zhuǎn)移酶參與光呼吸途徑;編碼產(chǎn)物定位于葉綠體的鐵超氧化物歧化酶(Fe-SOD)基因,該酶參與葉綠體內(nèi)清除超氧陰離子的水-水循環(huán)過程。 5、通過對SOD基因的轉(zhuǎn)化實驗,建立了以G418為篩選劑的互補轉(zhuǎn)基因體系,這一轉(zhuǎn)化體系雖然與以潮霉素作為篩選劑的轉(zhuǎn)化體系比較其篩選效率相差甚遠(yuǎn),但是通過大量轉(zhuǎn)化應(yīng)該能夠滿足互補
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