1、草食性的草魚擁有著強大的分解水草的能力，同時，有研究報道在草魚腸道中檢測到纖維素酶活性或者產纖維素酶細菌。目前，對于草魚腸道內的產纖維素酶細菌有哪些，這些細菌是固有共生細菌還是因為攝食等其它原因產生的等問題，并不是很清楚。甄別宿主體內細菌是固有細菌還是外來細菌，是了解細菌和宿主之間相互關系的前提。 通過對16srDNA文庫的隨機序列測序，本研究調查了空腹草魚腸道以及其他有著連接的組織（膽囊和肝胰臟）中的細菌多樣性和菌群豐度。結果

2、表明，（1）草魚腸道組織的細菌群落組成以氣單胞菌（Aeromonas）為主，其次依次為摩根菌（Morganella）、假單胞菌（Pseudomonas）和耶爾伸菌（Yersina），普羅威登斯菌（Providencia）、弧菌（Vibrio）和不動桿菌數量（Acinetobacter）相對較少；草魚膽囊以氣單胞菌（Aeromonas）為主，肝胰臟以氣單胞菌（Aeromonas）和假單胞菌（Pseudomonas）為主。（2）鑒定出腸道中

3、細菌28株、膽囊中10株和肝胰臟中19株，以上菌株均歸屬于變形桿菌的gamma亞群，分屬于不同的8個細菌屬。（3）在膽囊、肝臟和腸道均有分布的相同菌株，共有3株，其中2株隸屬于氣單胞菌和1株隸屬于假單胞菌。除此之外，膽囊和肝臟中相同菌株還有1株變形桿菌、2株氣單胞菌和1株假單胞菌；膽囊和腸道中相同菌株還有2株氣單胞菌、1株假單胞菌和1株摩根菌；肝臟和腸道中相同菌株還有1株氣單胞菌、1株假單胞菌和1株摩根菌；（4）這些共同擁有的細菌我們稱

4、之為共生細菌，在研究中一共找到了10種共生細菌，占了55.33％。這10種共生細菌在腸道中都能檢測到，在膽囊中有7種，肝胰臟中有6種。（5）這10種共生細菌都隸屬于三種細菌基因：氣單胞菌，假單胞菌和摩根菌。其中氣單胞菌數量最多，占28.38％，其次為摩根菌占20.78％，假單胞菌占6.17％。在這些細菌中，Morganellasp，JB-T11，Aeromonasveronii，和Aeromonassobria這三種細菌數量最多，分別占

5、了17.08％，12.35％和8.64％。 另外采用PCR-DGGE分子生物學策略以分析16SrDNA特征序列對細菌類群進行分析，共鑒定出草魚腸道中的13種細菌。草魚腸道組織中的細菌都隸屬于以下這五種細菌基因：氣單胞菌（Aeromonas），假單胞菌（Pseudomonas），耶爾森菌（Yersina），希瓦菌（Shewanella），沙門菌（Salminella）。其中，氣單胞菌為占優(yōu)勢的細菌，占了46.13％，其次為假單胞菌

6、，占了30.77％。耶爾森菌，希瓦菌，沙門菌各占7.69％。 運用改良過的剛果紅培養(yǎng)基篩選草魚腸道中的產纖維素酶細菌，得到產纖維素酶細菌的單克隆66個。其中透明水解圈D（mm）/菌落直徑d（mm）大于等于5的產纖維素酶細菌有19個。運用16SrDNA分子技術分析這19個細菌，得到3個不同序列和16個重復序列。其中兩個序列經過比對鑒定為Aeromonasveronii，另一個序列經過比對鑒定為Aeromonashydrophila

7、，這2種細菌均隸屬于氣單胞菌（Aeromonas）。這兩種細菌在草魚腸道和膽囊中都有被檢測到，說明這2種產纖維素酶細菌是草魚腸道中的共生細菌。Aeromonasveronii在草魚腸道中占了12.35％的相對豐度，Aeromonashydrophila在草魚腸道中占了1.23％的相對豐度。 本研究利用不依賴于細菌分離培養(yǎng)的分子鑒定技術，通過比較腸道以及與其相連接器官組織的細菌組成，確定了腸道共生細菌類群并得出了相對的種群優(yōu)勢，在