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文檔簡(jiǎn)介
1、犬類常見呼吸道疾病多發(fā)于春,秋,冬三季,夏季相對(duì)較少。臨床上犬呼吸道疾病主要由病毒引起,特別是犬瘟熱病毒(canine distemper virus,CDV),犬副流感病毒(canine parainfluenza virus,CPIV)和犬腺病毒Ⅱ型(canine adenovirus type-2,CAV-2)。已有不少研究者從不同角度用PCR方法對(duì)其進(jìn)行單一或與其他病毒聯(lián)合研究,本文主要針對(duì)此三種病毒建立多重PCR診斷方法。
2、r> 根據(jù)GeneBank上發(fā)布的CDV、CPIV和CAV-2完整的基因組,分別用NCBI的BLAST同源性分析對(duì)基因組進(jìn)行保守性分析,獲得各自的保守區(qū)序列:CDV中F基因序列的470~1989bp、CPIV中N基因序列的0~1658bp和CAV-2中全序列的25635~26230bp。本文采用Trizol方法同時(shí)提取含CDV、CPIV和CAV-2的陽(yáng)性樣本中的RNA和DNA,將RNA反轉(zhuǎn)錄成的cDNA與DNA等濃度等比例混合作為
3、PCR體系的陽(yáng)性模板。根據(jù)病毒保守序列設(shè)計(jì)引物,通過實(shí)驗(yàn)選擇最佳的引物組合對(duì)。將PCR反應(yīng)體系及反應(yīng)程序進(jìn)行優(yōu)化,建立同時(shí)擴(kuò)增CDV(500bp)、CPIV(293bp)和CAV-2(655bp)的多重PCR方法。取臨床上PCR檢測(cè)為陽(yáng)性的病料核酸進(jìn)行敏感性試驗(yàn)和特異性試驗(yàn),證明此方法在臨床檢測(cè)中具有高度特異性和敏感性。
在臨床上隨機(jī)收集39例呼吸道病犬的47份病料,用本文建立的多重PCR方法進(jìn)行檢測(cè),得到CDV陽(yáng)性率為2
4、0.5%,CPIV和CAV-2陽(yáng)性率均為5.13%。對(duì)陽(yáng)性病例樣本擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序,與設(shè)計(jì)引物所用的病毒保守序列對(duì)比分析。用t檢驗(yàn)和fisher精確檢驗(yàn)對(duì)CDV的PCR檢測(cè)與膠體金檢測(cè)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,結(jié)果顯示PCR檢出率與膠體金檢出率具有顯著性差異,PCR檢出為CDV陽(yáng)性病例的死亡率與膠體金檢測(cè)為CDV陽(yáng)性病例的死亡率也具有顯著性差異。
PCR方法是從核酸角度對(duì)病毒進(jìn)行驗(yàn)證,是近些年新出現(xiàn)適用于臨床的一種分子生物學(xué)技術(shù),檢測(cè)效率
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