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![淇河鯽MSTN基因相關(guān)microRNA的篩選與功能研究.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-2/24/12/bc402f50-62a9-496c-9355-0fdd9043cafe/bc402f50-62a9-496c-9355-0fdd9043cafe1.gif)
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文檔簡介
1、淇河鯽(Carassius auratus in Qihe River)屬于銀鯽的一種,天然雌核發(fā)育,脊背寬厚是區(qū)別于其它銀鯽魚最主要的特征。目前在淇河鯽育種、疾病免疫、飼料營養(yǎng)等方面已開展較多研究,但是淇河鯽生長性狀相關(guān)的基礎(chǔ)研究還相對薄弱,其脊背寬厚的生長機制尚不清楚。肌肉生長抑制素基因(myostatin,MSTN)是一種負(fù)調(diào)控因子,它最主要功能是調(diào)節(jié)動物的骨骼肌肉生長發(fā)育。microRNAs(miRNAs)是一類非編碼單鏈小RN
2、As,近年來它的作用和功能越來越多地被發(fā)掘。miRNAs技術(shù)的發(fā)展為探索淇河鯽脊背寬厚這一問題開辟了一條新的途徑。提取淇河鯽總RNA,克隆,得到淇河鯽MSTN3'UTR序列。根據(jù)MSTN3'UTR序列通過TargetScans等軟件預(yù)測出相關(guān)miRNAs,再利用RNAhybrid軟件進(jìn)行驗證,最終選取miR-181a和miR-181b作為候選miRNAs。以肌肉總DNA為模板,獲得pri-miR-181a和pri-miR-181b全長。
3、構(gòu)建真核表達(dá)載體和miRNA慢病毒載體,通過雙熒光檢測和熒光原位雜交技術(shù)分別從分子水平和組織細(xì)胞定位方面確定MSTN和miR-181a、miR-181b之間的相互關(guān)系。采用qRT-PCR分析miR-181a、miR-181b和MSTN在淇河鯽腦、肌肉和心臟等8個組織的表達(dá)情況以及miR-181a、miR-181b和MSTN在胚胎發(fā)育及其在前期生長不同階段的表達(dá)情況。由此進(jìn)一步揭示淇河鯽肌肉生長相關(guān)基因間的多層次網(wǎng)絡(luò)調(diào)控模式,探索淇河鯽肌
4、肉生長機制。
1、淇河鯽MSTN基因3'UTR的克隆
提取總RNA,克隆得到MSTN基因3'UTR,拼接后獲得3'UTR長度是865bp。在NCBI中,經(jīng)過Blast比對發(fā)現(xiàn),得到片段與鯉形目魚類相似度較高,尤其與南亞野鯪(Labeo rohita)(91%,KR052242.1)和鯉魚(Cyprinus carpio)(92%,LN590705.1),淇河鯽(Carassius auratus in Qihe ri
5、ver)(88%,KC851952.1)同源性最高。
2、淇河鯽MSTN基因相關(guān)miRNAs的預(yù)測、驗證及克隆
根據(jù)MSTN基因3'UTR序列結(jié)果,利用RegRNA、Pictar、TargetScan、miRWalk、miRDB等軟件,,預(yù)測相關(guān)miRNAs,進(jìn)一步用RNAhybrid軟件驗證,選取可能與MSTN基因相關(guān)的miR-181a和miR-181b作為候選miRNAs。從淇河鯽肌肉中提取總DNA,克隆pri-
6、miR-181a和pri-miR-181b。
3、真核載體的構(gòu)建及雙熒光檢測
本實驗中把MSTN3'UTR序列和加突變位點的3'UTR序列雙酶切,連接至pmirGLO載體;pri-miR-181a/b雙酶切,連接至Lenti H1載體,分別構(gòu)建真核表達(dá)載體和miRNAs慢病毒載體。構(gòu)建的兩個載體共轉(zhuǎn)染至293T細(xì)胞,雙熒光檢測發(fā)現(xiàn),miR-181a/b對MSTN基因均可能有一定的抑制作用,此外還發(fā)現(xiàn)miR-181a/
7、b與MSTN還可能存在其他的結(jié)合位點共同作用調(diào)節(jié)MSTN基因的表達(dá)。
4、MSTN和miR-181a在肌肉組織中的表達(dá)定位
取淇河鯽背部和腹部肌肉,制成石蠟切片,合成探針,檢測MSTN基因和miR-181a在肌肉組織中的表達(dá)位置。結(jié)果表明,MSTN在肌纖維中表達(dá)量較高;miR-181a在肌漿膜中表達(dá)量較高,并且在結(jié)締組織中也有表達(dá)。此外還發(fā)現(xiàn)miR-181a在背部肌肉的表達(dá)量低于腹部,在腹部肌纖維中MSTN表達(dá)量顯著
8、高于背部,因此推測在背部肌肉中miR-181a對MSTN的抑制作用可能沒有腹部明顯。
5、淇河鯽MSTN基因及相關(guān)miR-181a/b特異性表達(dá)
qRT-PCR結(jié)果顯示,淇河鯽MSTN基因在不同組織表達(dá)量存在顯著性差異,其中心肌和腦中最高,肌肉其次,腎臟最低;胚胎發(fā)育及前期生長不同階段,MSTN基因在原腸胚以前,出生20d表達(dá)量顯著高于其他時期。miR-181a在肌肉和鰓的表達(dá)豐度顯著高于其他組織,在原腸胚以前和孵化
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