灰氈毛忍冬花管開裂相關(guān)基因ZFp-1全長克隆與表達(dá)分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文以灰氈毛忍冬花管為研究材料,在轉(zhuǎn)錄測序的基礎(chǔ)上,應(yīng)用RT-PCR和RACE技術(shù)分離得到一個具有鋅指結(jié)構(gòu)的基因ZFP-1,并對ZFP-1基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析、熒光定量表達(dá)等方面的研究分析,通過該基因在花器官發(fā)育不同時期的表達(dá)模式,推測該基因在花器官發(fā)育過程中起到調(diào)控作用,為灰氈毛忍冬花管開裂的分子調(diào)控機(jī)制進(jìn)一步研究奠定了理論基礎(chǔ),為灰氈毛忍冬分子育種提供理論基礎(chǔ),本研究主要結(jié)果如下:
  (1)通過RT-PCR和RACE技術(shù)分

2、離得到ZFP-1基因的全長cDNA序列,該基因全長1647bp,包括一個長度為1116bp的完整開放閱讀框(ORF),3'非編碼區(qū)長205bp、5'非編碼區(qū)長326bp,編碼371個氨基酸的蛋白質(zhì),在GenBank上登錄號為KR013240。與其它物種相比,核苷酸序列比對發(fā)現(xiàn)該序列與梅花、碧桃、可可、蘋果和柑橘的序列同源性分別為77%、77%、76%、76%和75%。
  (2)灰氈毛忍冬ZFP-1基因蛋白屬于鋅指蛋白基因家族中的

3、一員,其N端具有一個115個左右氨基酸的BTB/POZ結(jié)構(gòu)域,C端有一個zf-TAZ鋅指結(jié)構(gòu),與其它物種相比,氨基酸序列比對發(fā)現(xiàn)該序列與可可ZFP氨基酸序列同源性高達(dá)75%,與葡萄ZFP氨基酸序列同源性為74%。
  (3)ZFP-1基因編碼的蛋白質(zhì)推測其分子量為4.28kD,理論等電點(diǎn)為9.18。20種基本氨基酸全部都有出現(xiàn),其中,非極性氨基酸占總氨基酸的46.1%,不帶電荷的極性氨基酸占總氨基酸的24.5%,帶正點(diǎn)(堿性)的氨

4、基酸占總氨基酸的18.1%,帶負(fù)點(diǎn)(酸性)氨基酸占總氨基酸的11.3%。整體上看,ZFP-1蛋白中極性氨基酸數(shù)量略高于非極性氨基酸的數(shù)量。由此可以推測,ZFP-1蛋白為親水性蛋白。
  (4)ZFP-1基因編碼的蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)以卷曲和螺旋結(jié)構(gòu)為主,在接近N端的位置存在一個跨膜結(jié)構(gòu),位于104~122氨基酸處,長度為19個氨基酸,另外還存在一個信號肽序列,位于1~70氨基酸處。
  (5)qRT-PCR分析表明,ZFP-1基因

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