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![大豆脂肪酸代謝相關(guān)基因單核苷酸多態(tài)性.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/11/8/cf547f3a-62bb-4f30-8b97-e37db6b40ad3/cf547f3a-62bb-4f30-8b97-e37db6b40ad31.gif)
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文檔簡介
1、大豆是人類植物蛋白質(zhì)和食用油脂的主要來源之一,大豆種子中的脂肪酸含量和組成是判定大豆品質(zhì)的重要指標,研究大豆脂肪酸代謝相關(guān)基因及其與脂肪酸含量和組成的關(guān)系具有重要意義。本文選取野生大豆、栽培大豆地方品和育成品種各20份為材料,系統(tǒng)地研究大豆脂肪酸代謝相關(guān)基因的單核苷酸多態(tài)性及其在馴化和育種過程中的變化規(guī)律,為闡明脂肪酸代謝相關(guān)基因與大豆脂肪酸含量和組成之間的關(guān)系,克隆決定大豆脂肪酸含量和組成的關(guān)鍵基因奠定基礎(chǔ)。主要結(jié)果如下:
2、 1、測序獲得了60份大豆材料在35個脂肪酸代謝相關(guān)基因上總長度為23501 bp的DNA序列,共發(fā)現(xiàn)了224個SNPs位點。分別在野生、地方和育成大豆中分別發(fā)現(xiàn)了213、121和112個SNPs,其中稀有SNPs的個數(shù)分別是90、40和28個。野生、地方和育成大豆的θ值分別為2.01×10-3,1.13×10-3,1.08×10-3,π值分別為2.16×10-3,1.27×10-3,1.25×10-3。這表明在馴化過程中脂肪酸代謝相
3、關(guān)基因SNPs數(shù)目和頻率顯著減少,其中減少的主要是稀有SNPs,而育種對大豆脂肪酸代謝相關(guān)基因SNPs頻率的影響非常有限。
2、總長度為23501 bp的DNA序列包含了7899 bp的編碼區(qū)序列和15602 bp的非編碼區(qū)序列。在編碼區(qū)中,發(fā)現(xiàn)了41個SNPs,野生、地方和育成大豆的θ值分別為1.30×10-3、0.93×10-3和0.96×10-3,π值分別為1.31×10-3、1.01×10-3和0.99×10-3;
4、非編碼區(qū)中發(fā)現(xiàn)了183個SNPs,野生、地方和育成大豆的θ值分別為2.37×10-3、1.23×10-3和1.14×10-3,π值分別為2.58×10-3、1.41×10-3和1.41×10-3。編碼區(qū)中,引起同義突變的SNPs在野生、地方和育成大豆的θ值分別為0.79×10-3、0.54×10-3和0.46×10-3,π值分別0.80×10-3、0.58×10-3和0.51×10-3;引起非同義突變的SNPs,野生、地方和育成大豆的θ
5、值分別為0.54×10-3、0.39×10-3和0.50×10-3,π值分別0.51×10-3、0.43×10-3和0.41×10-3。以上結(jié)果表明,脂肪酸代謝相關(guān)基因非編碼區(qū)的SNPs頻率明顯高于編碼區(qū)SNPs頻率,且在馴化過程中減少的程度更大,編碼區(qū)中引起同義突變的SNPs頻率在訓(xùn)化和育種過程中減少的程度比引起非同義突變的更大。
3、在35個脂肪酸代謝相關(guān)基因中關(guān)鍵酶基因有15個,非關(guān)鍵酶基因有20個。關(guān)鍵酶中,野生、
6、地方和育成大豆的θ值分別為2.07×10-3、1.35×10-3和1.29×10-3,π值分別為2.13×10-3,1.58×10-3和1.58×10-3;非關(guān)鍵酶中野生、地方和育成大豆的θ值分別為1.98×10-3、0.97×10-3和0.93×10-3,π值分別為2.17×10-3、1.05×10-3和1××10-3。非關(guān)鍵酶基因的SNPs頻率小于關(guān)鍵酶基因,在馴化過程中SNPs頻率的減少也更為顯著。
4、224個SN
7、Ps共組成251種單倍型。在野生、地方和育成大豆中分別為197、111和104種;單倍型多樣性分別為0.57、0.36和0.35;遺傳分化系數(shù)分別為O.1067、0.118和0.0285。三個群體間的平均單倍型多態(tài)性(Hs)為0.42,總單倍型多態(tài)性(Ht)為0.48。野生大豆與栽培大豆之間的遺傳分化系數(shù)遠高于地方大豆與育成大豆之間的遺傳分化系數(shù),說明馴化過程對大豆脂肪酸代謝相關(guān)基因的影響要比育種過程大得多。
5、用Taj
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