假高粱及近似種的醇溶蛋白電泳和PCR鑒定.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、假高粱[Sorghum halepense(L.)Pers]是世界十大惡性雜草之一,被我國列為進境植物危險性有害生物。它有多個近似種,如黑高粱(S.almum)、光高粱(S.nitidum)、擬高粱(S.propinquum)、蘇丹草(S.sudanense)和二色高梁(S. bicolor)等,在形態(tài)特征上極為近似,給鑒定帶來了很大的難度;同時由于假高粱及近似種的種子往往夾雜在進出境的農產品中傳播,其形態(tài)特征往往會因運輸過程中的顛簸磨

2、損而不完整或完全丟失,給準確鑒定假高粱及其近似種帶來了很大的不確定性。為快速準確的檢測假高粱及其近似種,本文在分析醇溶蛋白SDS-PAGE和DNA序列差異的基礎上,建立了假高粱及其近似種的醇溶蛋白電泳和PCR檢測方法。 參考國際種子協(xié)會(ISTA)推薦的醇溶蛋白研究方法,以高粱種子為材料,大麥、小麥、玉米等為參照,研究了不同提取劑、提取劑用量、濃度和還原劑濃度對高粱種子醇溶蛋白提取的影響。蛋白濃度測定和SDS-PAGE電泳表明,

3、60%叔丁醇加入4%DTT、樣品質量比提取劑用量為1:8(g/mL)為提取高梁種子醇溶蛋白的最佳條件。該條件下,提取高梁屬不同種的種子醇溶蛋白,得到的高粱屬種子醇溶蛋白的“指紋”圖譜表明,種間醇溶蛋白譜帶的條帶數、帶型以及深淺度存在差異,可以用來區(qū)分高粱屬內各種。 據GenBank中二色高粱的一段927Kb的ChiB DNA序列設計一對通用引物D16/D18,PCR擴增并分析了假高粱及其近似種ChiB序列的差異,結果表明,假高粱

4、與黑高粱的擴增產物為567-607bp,親緣關系較近達97.5-100%,聚類分為一組;擬高粱、二色高粱等聚為一組,它們之間的相似度為95.1-97.6%;光高粱的遺傳距離最遠,與其他供試材料的相似度只有72.3-74.7%,自為一組。根據序列分析結果設計了特異引物D51/D55,可以鑒定檢疫性雜草假高粱和黑高粱。 根據高粱屬核糖體內轉錄間隔區(qū)(ITS)序列,設計引物S3/S9,PCR擴增和分析結果表明,二色高粱、喀麥隆高粱、假

5、高粱、黑高粱的ITS部分序列長度為597bp,擬高粱的長度為598bp,屬于同一組,親緣關系較近為98.8-100%,多色高粱的長度為598bp,光高粱為602bp,二者親緣關系較近為96.9-97.2%。序列分析結果支持將光高粱也歸為多色高粱所在的擬似高粱區(qū)組。在分析序列的基礎之上,設計的光高粱鑒定引物N3/N5,可以將光高粱從其它近似種中區(qū)分開來。利用乙醇脫氫酶1(Adh1)部分序列設計引物SW11/SW17,SW22/SW24,S

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