溶澡弧菌PCR檢測及SSCP在毒力株鑒定的應(yīng)用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究選擇gyrB基因?yàn)榘谢?,以溶藻弧菌種特異性區(qū)域設(shè)計(jì)特異性引物,該引物能將典型溶藻弧菌與其它弧菌或非弧菌細(xì)菌區(qū)分開來。為了進(jìn)一步驗(yàn)證該檢測技術(shù)的準(zhǔn)確性,進(jìn)行為期一年的實(shí)樣檢測。該P(yáng)CR從874株細(xì)菌里檢測出77株陽性菌,經(jīng)過SSCP分析,該77株陽性菌分屬于4個分子型,通過對不同分子型的陽性菌株進(jìn)行抽樣測序,結(jié)果表明抽選的所有陽性菌株的gyrB基因片段序列與溶藻弧菌的同源性最高,由此認(rèn)為均為溶藻弧菌,所以該P(yáng)CR檢測技術(shù)準(zhǔn)確率為1

2、00%。基于gyrB基因片段的SSCP分型,可將77株溶藻弧菌分為4個分子型:a、b、c和d型,而基于膠原蛋白酶基因片段的分型,可將77株溶藻弧菌分為13個分子型:A1、A2、A3、A4、B、C、D、E、F、G1、G2、H和I型,分辨率得到很大提高。其中A1型是優(yōu)勢分子型,占總數(shù)的48.1%。從南油分離的菌株的多態(tài)性明顯高于特呈和麻斜,25個菌株包含了11個分子型,其中A3、A4、E、G1和G2型,是南油所獨(dú)有的,A2型也主要分布于南油

3、。從麻斜分離的菌株的多念性也較為豐富,29個菌株可分出7個分子型,其中H和I型是麻斜獨(dú)有的。從特呈分離的菌株的多態(tài)性最低,23個菌株只包含4個分子型。除了D型主要分布于特呈外,其它三個分子型都普遍存在于三個養(yǎng)殖區(qū)。根據(jù)gyrB和膠原蛋白酶-SSCP型的組合將細(xì)菌分組,每個組合代表一種基因遺傳型,可分為15個遺傳型,然后每組隨機(jī)挑選若干菌株進(jìn)行致病性實(shí)驗(yàn)。發(fā)現(xiàn)溶藻弧菌的毒力與膠原蛋白酶-SSCP分型呈相關(guān)關(guān)系(r=0.438 p<0.01

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