畢赤酵母表達XRN1蛋白及響應面法優(yōu)化基礎鹽發(fā)酵培養(yǎng)基.pdf_第1頁
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1、5'-3'核糖核酸外切酶(XRN1)是一個在基因表達過程中與RNA代謝和RNA干擾等重要功能相關的保守酶大家族,存在于所有真核生物中,簡稱5PX。XRN1能持續(xù)降解5'端單磷酸的RNA,而不能對5'端三磷酸、5'帽子結構、5'羥基的RNA發(fā)揮作用。在總RNA中,rRNA含量最高,原核生物的16S與23SrRNA和真核生物18S與28SrRNA5'端均為單磷酸,末端核酸外切酶XRN1可將這些rRNA降解去除,而達到富集mRNA的目的。

2、r>   已知釀酒酵母S288c的Xrn1基因序列長4587bp,編碼1528aa。通過生物學軟件對其蛋白分子量和等電點進行預測,得出分子量約為175kDa,等電點在7.3左右。本論文利用畢赤酵母表達系統(tǒng)重組表達釀酒酵母S288c的XRN1,篩選高效表達XRN1重組蛋白的體系,同時優(yōu)化基礎鹽發(fā)酵培養(yǎng)基,進行擴大培養(yǎng)及誘導表達,并分離純化重組蛋白,鑒定重組酶活性,為mRNA的富集奠定基礎。
   通過構建真核表達載體pPIC3.

3、5K-Xrn1,重組載體經SalⅠ線性化后,電擊轉入畢赤酵母GS115,然后通過甲醇誘導實現了XRN1蛋白在畢赤酵母中的胞內表達。結果表明酵母胞內表達量組菌可以表達全長XRN1重組蛋白,經Western blotting鑒定其大小約為175kDa,與目的蛋白大小基本相符。用Bradford法可測純化濃縮后的真核蛋白酶液的濃度:活性檢測表明,此重組蛋白具有5'-3'核糖核酸酶活性。
   最后利用響應面法對畢赤酵母初始鹽發(fā)酵培養(yǎng)基

4、進行優(yōu)化。首先應用Plackett-Burman(PB)設計法對影響XRN1蛋白表達的發(fā)酵培養(yǎng)基組分進行篩選,選取的8個相關因子為:酵母提取物、硫酸鈣、MgSO4·7H2O、甘油、硫酸鉀、磷酸、硫酸銨和氫氧化鉀。統(tǒng)計分析表明,影響XRN1蛋白表達的關鍵因子為酵母提取物、硫酸鎂和硫酸鉀。再進行最陡爬坡試驗逼近3個關鍵因素的最大響應區(qū)域的基礎上,采用Box-Behnken Design法對發(fā)酵培養(yǎng)基組分進行優(yōu)化,其最佳條件為酵母提取物0.4

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