水稻細(xì)菌性條斑病菌突變體庫(kù)的構(gòu)建與致病相關(guān)基因的篩選.pdf_第1頁(yè)
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1、水稻細(xì)菌性條斑病菌(Xanthomonasoryzaepathovaroryzicola,簡(jiǎn)稱Xoc)是水稻的主要病原菌之一,其引發(fā)的水稻細(xì)菌性條斑病可造成水稻嚴(yán)重減產(chǎn)。但目前還沒(méi)有有效的方法控制該病的發(fā)生,國(guó)內(nèi)外對(duì)Xoc的分子致病機(jī)理的研究還處于初步階段,因此系統(tǒng)地研究該菌致病相關(guān)基因的功能是非常有必要的。本研究從廣西分離株LT4分離到具有利福平抗性的野生型菌株XocGX01作為建庫(kù)出發(fā)菌株。首先對(duì)其進(jìn)行了分子鑒定,致病力檢測(cè)和表型分

2、析,證明其確實(shí)為水稻細(xì)條病菌。采用EZ:TN轉(zhuǎn)座子簽法構(gòu)建了XocGX01菌株的Tn5隨機(jī)插入突變體庫(kù),共獲得52,392個(gè)突變體,轉(zhuǎn)化效率較高。利用改良后的針刺接種法在水稻日本晴品種上進(jìn)行致病性試驗(yàn),從572個(gè)Tn5轉(zhuǎn)座子插入突變體中篩選到致病性明顯下降或完全喪失的突變體48株,并對(duì)它們進(jìn)行致病力評(píng)價(jià)分析,發(fā)現(xiàn)它們的致病力的降低程度不同,其中下降大于70%的有7株。為了了解這48個(gè)致病力下降突變體其表型的變化,對(duì)它們進(jìn)行了表型分析。結(jié)

3、果顯示,其中大部分致病缺陷的突變體其表型都有不同的變化。利用TAIL-PCR(ThermalasymmetricinterlacedPCR)的方法分離出突變體基因組中的Tn5轉(zhuǎn)座子側(cè)翼片段,經(jīng)測(cè)序分析和序列比對(duì),將這48個(gè)突變體的Tn5轉(zhuǎn)座子插入位點(diǎn)進(jìn)行了定位,定位到39個(gè)基因。結(jié)果表明,這些突變體的表型和致病力與定位出來(lái)的基因的功能對(duì)應(yīng)程度較高。這48個(gè)突變體涉及到39個(gè)不同的基因,包括:已知的致病相關(guān)基因,分別是與分泌系統(tǒng)、胞外多糖

4、和脂多糖合成有關(guān)的基因;一部分與細(xì)菌基礎(chǔ)代謝、基因調(diào)節(jié)相關(guān)的基因;6個(gè)編碼產(chǎn)物都注釋為假設(shè)蛋白的基因,未見(jiàn)與致病性相關(guān)的報(bào)道,可能參與DNA甲基化、RNA結(jié)構(gòu)形成以及其它未知生物學(xué)功能。為了確定這6個(gè)基因是致病相關(guān)基因從而證明該突變體庫(kù)的正確性,對(duì)其中一個(gè)基因的突變體進(jìn)行功能互補(bǔ),結(jié)果表明其互補(bǔ)菌株的表型及致病力都能恢復(fù)到野生型的水平,說(shuō)明該突變體是正確可信的。進(jìn)而說(shuō)明采用EZ:TN轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽法構(gòu)建的Tn5突變體庫(kù)作為篩選以及研究致病相

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