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![阿霉素誘導耐藥肝癌細胞株miRNAs表達譜檢測及miR-1246作用研究.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/19/12/cd0056a8-9bdf-42d5-b3cb-8ba6503021e4/cd0056a8-9bdf-42d5-b3cb-8ba6503021e41.gif)
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文檔簡介
1、第一章人肝癌耐藥細胞株SMMC-7721/ADM的建立及其與人肝癌細胞株SMMC-7721及人正常肝細胞株LO2的miRNAs表達譜分析
目的
探討人肝癌耐藥細胞株SMMC-7721/ADM與其親本細胞SMMC-7721及人正常肝細胞株LO2的miRNAs的差異表達
方法
(1) MTT法測定阿霉素對SMMC-7721的IC50,以其為起始濃度及采用順濃度梯度法培養(yǎng)SMMC-7721,建立耐藥細胞
2、株SMMC-7721/ADM,繪制兩細胞株的生長曲線及計算倍增時間,MTT法測ADM對SMMC-7721/ADM的IC50及計算耐藥指數(shù),westernblotting測定LO2,SMMC-7721及SMMC-7721/ADM的MDR1蛋白表達。
(2) miRNA芯片分析人肝癌細胞株SMMC-7721與SMMC-7721/ADM及人正常肝細胞株LO2中差異表達的miRNAs,并采用RT-PCR驗證芯片結果。
結果<
3、br> (1) ADM對SMMC-7721的IC50為0.12±0.01μg/ml,兩細胞株有相似的生長曲線,倍增時間無明顯差異(p>0.05),ADM對SMMC-7721/ADM的IC50為2.96±0.12μg/ml。耐藥指數(shù)為24.67。MDR1蛋白在SMMC-7721/ADM中表達高于其親本細胞SMMC-7721及LO2(p<0.05),SMMC-7721高于正常肝細胞株LO2(p<0.05)。
(2)通過芯片篩選,
4、 LO2與SMMC-7721相比,上調(diào)2倍以上的miRNAs有189個,下調(diào)2倍以上的有246個。SMMC-7721與SMMC-7721/ADM上調(diào)2倍以上的有176個,下調(diào)2倍以上的有159個。SMMC-7721/ADM與LO2相比上調(diào)2倍的有160個,下調(diào)2倍的有134個。在LO2,SMMC-7721,SMMC-7721/ADM中表達差異兩倍以上且依次上調(diào)的有miR-1246,miR-3676-5p,miR-4443,依次下調(diào)的有m
5、iR-101-3p, miR-1469。RT-PCR驗證了miR-1246與miR-1469在LO2,SMMC-7721,SMMC-7721/ADM中的表達量,其結果與芯片相一致(p>0.05)。
結論
(1)我們成功構建了SMMC-7721/ADM。
(2)通過對LO2,SMMC-7721,及SMMC-7721/ADM的miRNA芯片分析篩選出依次顯著上調(diào)的miR-1246, miR-3676-5p和mi
6、R-4443;和依次顯著下調(diào)的有miR-101-3p,miR-1469。并對miR-1246與miR-1469進行驗證,證明了芯片結果的可靠性。
第二章miR-1246在肝癌耐藥細胞株SMMC-7721/ADM的研究
目的:
探討miR-1246在人肝癌耐藥細胞株SMMC-7721/ADM中的作用研究
方法:
(1)設計及合成miR-1246 inhibitor片段,轉(zhuǎn)染至SMMC-77
7、21/ADM,RT-PCR測定SMMC-7721,SMMC-7721/ADM空白轉(zhuǎn)染組及SMMC-7721/ADM目的轉(zhuǎn)染組及中miR-1246的表達量。
(2)實驗分組:A組為SMMC-7721,B組為SMMC-7721/ADM空白轉(zhuǎn)染組,C組為SMMC-7721/ADM目的轉(zhuǎn)染組。
(3) MTT檢測三組細胞株的增殖能力,并測定ADM對SMMC-7721/ADM目的轉(zhuǎn)染組的IC50。
(4)FCM檢測三
8、組細胞株的細胞周期。
(5) FCM AV-PI檢測三組細胞株的細胞凋亡。
(6) Transwell檢測三組細胞株的遷移能力。
(7)鋪matrigel的Transwell檢測三組細胞株的侵襲能力。
結果:
(1)顯微熒光鏡下觀察轉(zhuǎn)染效率達到85%左右,目的轉(zhuǎn)染組miR-1246含量低于空白轉(zhuǎn)染組(p<0.05),與SMMC-7721無明顯差異(p>0.05)。
(2)MTT
9、實驗結果顯示C組的增殖能力較A、B組下降(p<0.05),B組與A組無明顯差異(p>0.05)。ADM對C組的IC50為0.08±0.01μg/ml。與SMMC-7721/ADM的IC50(2.96±0.12μg/ml)相比顯著下降(p<0.01),與SMMC-7721(0.12±0.01μg/ml)相比無明顯差異(p>0.05)。
(3)細胞周期實驗示三組細胞株各周期之比無明顯差異(P>0.05)
(4)細胞凋亡實
10、驗示C組與A、B組相比其凋亡率升高且有統(tǒng)計學意義(p<0.05),B組與A組無明顯統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
(5)遷移能力實驗結果顯示C組的遷移能力低于B組(p<0.05),與A組則無明顯統(tǒng)計學意義(p>0.05),B組遷移能力高于A組(p<0.05)。
(6)侵襲實驗結果顯示C組的侵襲能力低于B組,與A組無明顯統(tǒng)計學意義(p>0.05),B組侵襲能力高于A組(p<0.05)。
結論:
(1)
11、在SMMC-7721/ADM中,通過與親本細胞SMMC-7721分析,細胞增殖、細胞周期及細胞凋亡無明顯差異,而遷移侵襲能力明顯增強。提示miR-1246的上調(diào)可能參與SMMC-7721/ADM的侵襲遷移能力的提高。
(2)通過對轉(zhuǎn)染miR-1246 inhibitor的SMMC-7721/ADM分析,細胞增殖能力降低,凋亡數(shù)增加。提示miR-1246的上調(diào)可增加耐藥肝癌細胞株的增殖能力,抑制凋亡,但對細胞周期無明顯影響;細胞
12、侵襲和遷移實驗的降低表明miR-1246的上調(diào)可提高耐藥肝癌細胞株的遷移與侵襲能力,轉(zhuǎn)染miR-1246 inhibitor的SMMC-7721/ADM的48h IC50明顯下降,提示miR-1246的下調(diào)使ADM對SMMC-7721/ADM敏感性增加
第三章hsa-miR-1246的生物信息學分析及靶基因預測驗證
目的:
對has-miR-1246進行生物信息學分析及靶基因預測和在耐藥肝癌細胞株中的靶基因
13、驗證。
方法:
(1)通過TargetScan、miRanDa和miRDB三個靶基因預測網(wǎng)站,對其進行靶基因初步篩選,選擇3個網(wǎng)站數(shù)據(jù)庫的交集基因行下一步預測研究。用DAVID數(shù)據(jù)庫對miR-1246的靶基因集合行GO注釋和KEGG的生物通路富集分析。
(2)確立在肝癌耐藥細胞株中的靶基因,并采用western-blotting及RT-PCR驗證。
結果:
(1) hsa-miR-124
14、6在TargetScan、miRanDa、 miRDB數(shù)據(jù)庫預測靶基因,其結果為TargetScan為178個,miRanDa為5983個,miRDB為398個,總共交集預測靶基因為57個。其中GSK3β,UNC5,SEMA6a參與KEGG通路為AXON GUIDANCE通路(Rho GTPase1家族通路)。
(2) GSK3β蛋白和mRNA表達在SMMC-7721/ADM目的轉(zhuǎn)染組均高于SMMC-7721/ADM空白轉(zhuǎn)染組
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