阿霉素誘導耐藥肝癌細胞株miRNAs表達譜檢測及miR-1246作用研究.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩102頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權,請進行舉報或認領

文檔簡介

1、第一章人肝癌耐藥細胞株SMMC-7721/ADM的建立及其與人肝癌細胞株SMMC-7721及人正常肝細胞株LO2的miRNAs表達譜分析
  目的
  探討人肝癌耐藥細胞株SMMC-7721/ADM與其親本細胞SMMC-7721及人正常肝細胞株LO2的miRNAs的差異表達
  方法
  (1) MTT法測定阿霉素對SMMC-7721的IC50,以其為起始濃度及采用順濃度梯度法培養(yǎng)SMMC-7721,建立耐藥細胞

2、株SMMC-7721/ADM,繪制兩細胞株的生長曲線及計算倍增時間,MTT法測ADM對SMMC-7721/ADM的IC50及計算耐藥指數(shù),westernblotting測定LO2,SMMC-7721及SMMC-7721/ADM的MDR1蛋白表達。
  (2) miRNA芯片分析人肝癌細胞株SMMC-7721與SMMC-7721/ADM及人正常肝細胞株LO2中差異表達的miRNAs,并采用RT-PCR驗證芯片結果。
  結果<

3、br>  (1) ADM對SMMC-7721的IC50為0.12±0.01μg/ml,兩細胞株有相似的生長曲線,倍增時間無明顯差異(p>0.05),ADM對SMMC-7721/ADM的IC50為2.96±0.12μg/ml。耐藥指數(shù)為24.67。MDR1蛋白在SMMC-7721/ADM中表達高于其親本細胞SMMC-7721及LO2(p<0.05),SMMC-7721高于正常肝細胞株LO2(p<0.05)。
  (2)通過芯片篩選,

4、 LO2與SMMC-7721相比,上調(diào)2倍以上的miRNAs有189個,下調(diào)2倍以上的有246個。SMMC-7721與SMMC-7721/ADM上調(diào)2倍以上的有176個,下調(diào)2倍以上的有159個。SMMC-7721/ADM與LO2相比上調(diào)2倍的有160個,下調(diào)2倍的有134個。在LO2,SMMC-7721,SMMC-7721/ADM中表達差異兩倍以上且依次上調(diào)的有miR-1246,miR-3676-5p,miR-4443,依次下調(diào)的有m

5、iR-101-3p, miR-1469。RT-PCR驗證了miR-1246與miR-1469在LO2,SMMC-7721,SMMC-7721/ADM中的表達量,其結果與芯片相一致(p>0.05)。
  結論
  (1)我們成功構建了SMMC-7721/ADM。
  (2)通過對LO2,SMMC-7721,及SMMC-7721/ADM的miRNA芯片分析篩選出依次顯著上調(diào)的miR-1246, miR-3676-5p和mi

6、R-4443;和依次顯著下調(diào)的有miR-101-3p,miR-1469。并對miR-1246與miR-1469進行驗證,證明了芯片結果的可靠性。
  第二章miR-1246在肝癌耐藥細胞株SMMC-7721/ADM的研究
  目的:
  探討miR-1246在人肝癌耐藥細胞株SMMC-7721/ADM中的作用研究
  方法:
  (1)設計及合成miR-1246 inhibitor片段,轉(zhuǎn)染至SMMC-77

7、21/ADM,RT-PCR測定SMMC-7721,SMMC-7721/ADM空白轉(zhuǎn)染組及SMMC-7721/ADM目的轉(zhuǎn)染組及中miR-1246的表達量。
  (2)實驗分組:A組為SMMC-7721,B組為SMMC-7721/ADM空白轉(zhuǎn)染組,C組為SMMC-7721/ADM目的轉(zhuǎn)染組。
  (3) MTT檢測三組細胞株的增殖能力,并測定ADM對SMMC-7721/ADM目的轉(zhuǎn)染組的IC50。
  (4)FCM檢測三

8、組細胞株的細胞周期。
  (5) FCM AV-PI檢測三組細胞株的細胞凋亡。
  (6) Transwell檢測三組細胞株的遷移能力。
  (7)鋪matrigel的Transwell檢測三組細胞株的侵襲能力。
  結果:
  (1)顯微熒光鏡下觀察轉(zhuǎn)染效率達到85%左右,目的轉(zhuǎn)染組miR-1246含量低于空白轉(zhuǎn)染組(p<0.05),與SMMC-7721無明顯差異(p>0.05)。
  (2)MTT

9、實驗結果顯示C組的增殖能力較A、B組下降(p<0.05),B組與A組無明顯差異(p>0.05)。ADM對C組的IC50為0.08±0.01μg/ml。與SMMC-7721/ADM的IC50(2.96±0.12μg/ml)相比顯著下降(p<0.01),與SMMC-7721(0.12±0.01μg/ml)相比無明顯差異(p>0.05)。
  (3)細胞周期實驗示三組細胞株各周期之比無明顯差異(P>0.05)
  (4)細胞凋亡實

10、驗示C組與A、B組相比其凋亡率升高且有統(tǒng)計學意義(p<0.05),B組與A組無明顯統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
  (5)遷移能力實驗結果顯示C組的遷移能力低于B組(p<0.05),與A組則無明顯統(tǒng)計學意義(p>0.05),B組遷移能力高于A組(p<0.05)。
  (6)侵襲實驗結果顯示C組的侵襲能力低于B組,與A組無明顯統(tǒng)計學意義(p>0.05),B組侵襲能力高于A組(p<0.05)。
  結論:
  (1)

11、在SMMC-7721/ADM中,通過與親本細胞SMMC-7721分析,細胞增殖、細胞周期及細胞凋亡無明顯差異,而遷移侵襲能力明顯增強。提示miR-1246的上調(diào)可能參與SMMC-7721/ADM的侵襲遷移能力的提高。
  (2)通過對轉(zhuǎn)染miR-1246 inhibitor的SMMC-7721/ADM分析,細胞增殖能力降低,凋亡數(shù)增加。提示miR-1246的上調(diào)可增加耐藥肝癌細胞株的增殖能力,抑制凋亡,但對細胞周期無明顯影響;細胞

12、侵襲和遷移實驗的降低表明miR-1246的上調(diào)可提高耐藥肝癌細胞株的遷移與侵襲能力,轉(zhuǎn)染miR-1246 inhibitor的SMMC-7721/ADM的48h IC50明顯下降,提示miR-1246的下調(diào)使ADM對SMMC-7721/ADM敏感性增加
  第三章hsa-miR-1246的生物信息學分析及靶基因預測驗證
  目的:
  對has-miR-1246進行生物信息學分析及靶基因預測和在耐藥肝癌細胞株中的靶基因

13、驗證。
  方法:
  (1)通過TargetScan、miRanDa和miRDB三個靶基因預測網(wǎng)站,對其進行靶基因初步篩選,選擇3個網(wǎng)站數(shù)據(jù)庫的交集基因行下一步預測研究。用DAVID數(shù)據(jù)庫對miR-1246的靶基因集合行GO注釋和KEGG的生物通路富集分析。
  (2)確立在肝癌耐藥細胞株中的靶基因,并采用western-blotting及RT-PCR驗證。
  結果:
  (1) hsa-miR-124

14、6在TargetScan、miRanDa、 miRDB數(shù)據(jù)庫預測靶基因,其結果為TargetScan為178個,miRanDa為5983個,miRDB為398個,總共交集預測靶基因為57個。其中GSK3β,UNC5,SEMA6a參與KEGG通路為AXON GUIDANCE通路(Rho GTPase1家族通路)。
  (2) GSK3β蛋白和mRNA表達在SMMC-7721/ADM目的轉(zhuǎn)染組均高于SMMC-7721/ADM空白轉(zhuǎn)染組

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權或不適當內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評論

0/150

提交評論