花生種質(zhì)資源基于InDel標(biāo)記的遺傳多樣性.pdf_第1頁(yè)
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1、種質(zhì)資源是作物遺傳改良的物質(zhì)基礎(chǔ)。花生種質(zhì)資源的遺傳多樣性的研究是種質(zhì)資源收集、鑒定和利用的有效方法,對(duì)發(fā)掘優(yōu)良種質(zhì)資源、拓寬育成品種的遺傳基礎(chǔ)等具有重要意義。AFLP、SSR等分子標(biāo)記相繼被開發(fā)并應(yīng)用于花生遺傳多樣性研究中,但由于多態(tài)性較低、成本較高等原因,成為制約花生分子標(biāo)記輔助選擇研究的瓶頸,因此開發(fā)多態(tài)性高的分子標(biāo)記用于遺傳多樣性的研究意義重大。InDel標(biāo)記作為一種新型共顯性標(biāo)記,具有重復(fù)性好、特異性高及檢測(cè)方法簡(jiǎn)捷的特點(diǎn),在

2、近些年來(lái)得到了快速的發(fā)展。InDel遍布于整個(gè)基因組,其中一些位于決定基因功能的關(guān)鍵性區(qū)域。InDel標(biāo)記已應(yīng)用于多種作物的品種鑒定、多樣性分析、高密度遺傳圖譜構(gòu)建及目標(biāo)性狀精細(xì)定位等方面的研究?;贗nDel標(biāo)記的高多態(tài)性、檢測(cè)方便的特征,本文利用InDel標(biāo)記對(duì)54份地方花生種質(zhì)資源的遺傳多樣性進(jìn)行了研究分析,首先明確InDel標(biāo)記在花生遺傳多樣性研究中有效性與可靠性,其次找到與InDel標(biāo)記相關(guān)的表型性狀或基因并加以探討。主要研究

3、結(jié)果如下:
  1.54份地方花生品種資源和104份美國(guó)微核心種質(zhì)資源的農(nóng)藝性狀考察結(jié)果顯示,微核心種質(zhì)包含我國(guó)未報(bào)道的植物學(xué)類型秘魯型資源,植株高大,單株結(jié)果數(shù)較多,單株產(chǎn)量較高;我國(guó)地方品種植株多為直立型,美國(guó)微核心種質(zhì)多為匍匐型;兩者主莖高及側(cè)枝長(zhǎng)變化范圍接近;微核心在單株果數(shù)與粒數(shù)上都占有較大優(yōu)勢(shì),但單株果重與單株粒重與我國(guó)地方品種較相近;我國(guó)地方品種各類型資源的百仁重和出仁率均高于微核心資源;美國(guó)微核心種質(zhì)對(duì)褐斑病、網(wǎng)斑

4、病的抗性均較高于我國(guó)地方品種,其中多粒型和秘魯型在抗褐斑病上表現(xiàn)優(yōu)異,而普通型在抗網(wǎng)斑病上抗性更高。這些結(jié)果為花生種質(zhì)資源的育種應(yīng)用提供了依據(jù)。
  2.利用48對(duì)InDel標(biāo)記對(duì)54份地方花生種質(zhì)資源進(jìn)行分子標(biāo)記掃描,其中24對(duì)具有多態(tài)性,共擴(kuò)增出126條清晰可見的條帶,其中51條為多態(tài)性條帶,多態(tài)性位點(diǎn)百分率為40.48%;各多態(tài)性引物的多態(tài)性比率主要集中于30%~60%,平均為39.17%。這些差異條帶可以揭示材料之間的遺傳

5、差異,表明InDel標(biāo)記的多態(tài)性較高。
  3.24對(duì)InDel引物在54份資源品種間的PIC的變幅為0.0364(InDel-028)~0.9030(InDel-001),Shannon's(Ⅰ)變幅為0.0922(InDel-028)~2.447(InDel-001),其中InDel-001,InDel-019,InDel-038,InDel-013,InDel-040和InDel-010最有效,其H'指數(shù)均在1.4以上,等位

6、變異數(shù)6個(gè)以上,有效變異數(shù)4.3個(gè)以上,表明有效等位變異數(shù)和H'值均能真實(shí)地反映其遺傳多樣性。
  4.NJ系統(tǒng)發(fā)育樹、主坐標(biāo)分析圖及STRUCTURE三種方法的結(jié)果顯示,花生地方種質(zhì)資源可明顯區(qū)分為疏枝亞種和密枝亞種兩大類,其中疏枝亞種包括多粒型和珍珠豆型,密枝亞種包括龍生型和普通型,且三者結(jié)果基本保持一致并且與預(yù)期相符。
  5.11個(gè)標(biāo)記與5個(gè)農(nóng)藝性狀相關(guān)聯(lián),決定系數(shù)R2的范圍為5.3%~33.2%。性狀分別為莢果長(zhǎng)、

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