耐輻射球菌DR-2566基因缺失突變株的構(gòu)建及其基因功能的初步分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:
  為了研究DR_2566基因在耐輻射球菌極端抗性機制中的作用,本課題通過生物信息學(xué)方法分析、預(yù)測其生物學(xué)功能并利用同源重組的方法,將目的基因進行基因敲除,獲得DR_2566缺失突變株。檢測DR_2566在紫外輻射、過氧化氫、絲裂霉素C等極端抗性中發(fā)揮的作用,對DR_2566基因功能初步進行研究。
  方法:
  1.對DR_2566基因及其對應(yīng)編碼蛋白DR_2566的高級結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)、生物學(xué)功能等,使用生物

2、信息學(xué)方法分析、預(yù)測。2.運用同源重組的方法構(gòu)建DR_2566基因缺失突變株。
  3.紫外輻照、過氧化氫及絲裂霉素C(Mitomycin,MMC)處理后,對野生型DR菌株、DR_2566基因缺失突變型DR菌株的生存率等進行分析,初步研究DR_2566基因在DR菌極端抗性中的功能。
  結(jié)果:
  1.生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,基于整體核苷酸序列的搜索,沒有發(fā)現(xiàn)其他生物的基因組中存在DR_2566的同源基因,這說明DR_

3、2566為DR菌基因組中特有的基因。結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果提示, DR_2566為限制性內(nèi)切酶家族(restriction_endonuclease_like superfamily)的一個成員,具有極短補丁修復(fù)(Very short patch repair,VSR)核酸內(nèi)切酶Vsr功能(復(fù)制,重組和修復(fù))。
  2.成功獲得了DR_2566基因上游片段、下游片段以及Kan抗性基因(含有GroEL基因啟動子)的三個片段。將獲得的三個片段

4、通過T4連接酶連接三片段后的回收產(chǎn)物轉(zhuǎn)化DR感受態(tài),經(jīng)卡那霉素Kan篩選,成功構(gòu)建了DR_2566基因缺失突變株。
  3.制作 DR_2566基因缺失突變株、野生株在紫外輻照、過氧化氫、絲裂霉素C處理下的存活率曲線,從中可以看出,DR_2566基因缺失突變株的存活率均明顯低于其野生型菌株的存活率,其差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。
  結(jié)論:
  DR_2566基因的缺失導(dǎo)致突變株對紫外輻射、過氧化氫、絲裂霉素C的

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