小鼠Bmall基因啟動子的克隆及其熒光素酶報告基因載體的構建.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:Bmal1基因又名MOP3或ARNTL(aryl-hydrocarbon receptor nuclear translocator like protein),是重要的轉錄因子,于1997年被實驗人員成功克隆。Bmal1基因包含Per-ARNT-Sim(PAS)和bHLH(basic Helix-Loop-Helix)結構域,具有結合DNA并作為轉錄因子調控基因轉錄的功能。多種模式生物中均存在Bmal1同源基因。其中,大鼠Bma

2、l1基因定位于1號染色體。利用報告基因系統(tǒng),發(fā)現(xiàn)Bmal1轉錄起始位點上游816bp到轉錄起始位點下游99bp區(qū)段的轉錄活性最強。序列比對發(fā)現(xiàn),這一區(qū)段含有多個轉錄因子的結合位點,對于Bmal1轉錄至關重要的因子也結合于這一區(qū)域。最新研究表明DNA甲基化對于Bmal1的轉錄發(fā)揮著核心調控作用,而受甲基化調控的CpG島也位于上述915bp區(qū)段。因此,該915bp的區(qū)段被廣泛用于Bmal1基因轉錄活性的研究。
  Bmal1基因并非在

3、所有的組織或細胞中均有表達。本實驗室的研究成果表明,胚胎干細胞在Bmal1的表達層面即表現(xiàn)出異質性。一部分細胞表現(xiàn)為Bmal1基因陽性,另一部分細胞表現(xiàn)為Bmal1陰性。這種異質性在胸腺和睪丸中也有所體現(xiàn)。目前尚無有效的方法能夠將Bmal1陽性和陰性的細胞區(qū)分篩選出來并進行后續(xù)的研究。本課題為了解決這一技術瓶頸,利用基因工程的方法和技術構建pLV-Bmal1-mCherry-EF1-copGFP-T2A-puro雙熒光載體。使我們可以很

4、便利的研究Bmal1啟動子在活體細胞和組織的生物學特性。
  方法:我們首先明確Bmal1基因啟動子區(qū)段。該啟動子起始于轉錄起始位點上游816位堿基,延伸至轉錄起始位點下游99位堿基,全長915個堿基。這一區(qū)段含有多個轉錄因子的結合位點,包括SP1,AP1,NF-Y。Rev-erb alpha,Rev-erb beta,RORa,RORb等對于Bmal1轉錄至關重要的因子也結合于這一區(qū)域。對于Bmal1的轉錄發(fā)揮著重要調控作用的D

5、NA甲基化影響的也是這一區(qū)段。該915bp的區(qū)段被廣泛用于Bmal1基因轉錄活性的研究。我們使用高保真酶,以小鼠肝臟基因組DNA為模板,擴增Bmal1啟動子序列。通過雙酶切將Bmal1基因啟動子克隆到慢病毒載體pLV-CMV-MCS-EF1-copGFP-T2A-puro中,從而得到中間克隆pLV-Bmal1-MCS-EF1-copGFP-T2A-puro。而后再次通過雙酶切,將紅色熒光蛋白(mCherry)克隆入pLV-Bmal1-M

6、CS-EF1-copGFP-T2A-puro中,從而得到最終目的克隆pLV-Bmal1-mCherry-EF1-copGFP-T2A-puro。將該克隆與pLP1、pLP2、pLP3,共同轉染293T細胞,進行病毒包裝。收獲病毒并經超離心純化獲得濃縮病毒。獲得的病毒感染293T細胞檢測病毒滴度。
  結果:以小鼠基因組DNA為模版,擴增得到Bmal1基因啟動子區(qū)段。經過兩步克隆成功最終目的克隆pLV-Bmal1-mCherry-E

7、F1-copGFP-T2A-puro,酶切和測序證實結構正確。該克隆中存在兩套報告基因系統(tǒng),其中紅色熒光蛋白的轉錄為Bmal1啟動子所控制,綠色熒光蛋白的轉錄為組成型啟動子EF1α所控制。之所以這樣設計,是考慮到慢病毒感染細胞的效率可能達不到100%。由于EF1α幾乎表達于所有種類的組織和細胞,當病毒成功感染靶組織或細胞時,細胞將表達綠色熒光蛋白,并發(fā)綠光。而未受病毒感染的細胞將不表達綠色熒光蛋白,從而不發(fā)光。只有發(fā)綠光的細胞才被認為是

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