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文檔簡(jiǎn)介
1、研究背景:
肺癌與慢性阻塞性肺疾?。╟hronic obstructive pulmonary disease,COPD)是呼吸系統(tǒng)最常見(jiàn)的兩種疾病,兩者關(guān)系極為密切。研究發(fā)現(xiàn)40-70%的肺癌患者伴發(fā)
COPD,而COPD患者的肺癌年發(fā)病率高達(dá)16.7/1000人年,遠(yuǎn)超正常人群。我們前期開(kāi)展的meta分析也顯示COPD患者發(fā)生肺癌的危險(xiǎn)度是正常人的2.76倍。COPD可能是肺癌癌前病變的一種中間表型,其在吸煙所致
2、的癌變過(guò)程中存在中介效應(yīng)。因此,對(duì)人群COPD的篩檢有助于肺癌的早期預(yù)防。對(duì)比分析國(guó)內(nèi)外多個(gè)有關(guān)肺癌和COPD的流行病學(xué)研究,我們發(fā)現(xiàn)兩種疾病的環(huán)境病因和遺傳易感位點(diǎn)存在廣泛的重疊,這提示肺癌與COPD可能具有共同的發(fā)病機(jī)制,這些機(jī)制也可能是COPD患者肺癌高發(fā)的病理基礎(chǔ)。
肺癌和 COPD的發(fā)病機(jī)制十分復(fù)雜,基因和環(huán)境因素相互作用,共同影響了兩種疾病的進(jìn)程。吸煙是兩者最主要的病因。我們通過(guò)比對(duì)有關(guān)肺癌、COPD及肺功能的全基
3、因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS),結(jié)果發(fā)現(xiàn)三者的易感基因在人類染色體上有廣泛的重疊,如位于人類染色體15q24區(qū)上的尼古丁受體基因家族(CHRNA3-CHRNB4-CHRNA5)、過(guò)氧化物歧化酶3(Superoxide dismutase3,SOD3)、mutS同源物6(mutS homolog6,MSH6)和鈣粘著蛋白關(guān)聯(lián)蛋白(cadherin-associated protein alpha2,CTNNA2)等。在體內(nèi),上述基因主要參與胞外
4、信號(hào)識(shí)別和磷酸化信號(hào)傳導(dǎo)、氧化應(yīng)激、DNA損傷修復(fù)和上皮細(xì)胞間質(zhì)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)等過(guò)程。目前,研究已證實(shí)尼古丁受體和 EMT與肺癌和 COPD的發(fā)病,以及 COPD發(fā)展為肺癌的過(guò)程相關(guān);而磷酸化信號(hào)傳導(dǎo)、氧化應(yīng)激、DNA損傷與修復(fù)等胞內(nèi)活動(dòng)也都參與了肺癌和 COPD的發(fā)病過(guò)程。此外,上述途徑之間還存在相互串話(cross-talk)機(jī)制?;谏鲜鯣WAS的結(jié)果和有關(guān)肺癌與C
5、OPD病理機(jī)制的報(bào)道,我們推測(cè),肺癌與 COPD可能存在共同的發(fā)病機(jī)制:環(huán)境因素作用于化學(xué)物受體,刺激細(xì)胞氧化應(yīng)激反應(yīng),直接損傷基因組 DNA和誘發(fā) EMT;同時(shí)環(huán)境因素與受體結(jié)合后產(chǎn)生應(yīng)激信號(hào),經(jīng)磷酸化信號(hào)通路級(jí)聯(lián)放大和轉(zhuǎn)移至核內(nèi),激活或抑制相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子,調(diào)控氧化應(yīng)激反應(yīng)和EMT進(jìn)程,共同促進(jìn)肺癌和COPD的發(fā)生。
目前,對(duì)于肺癌與COPD的關(guān)系認(rèn)識(shí),多數(shù)是來(lái)源于肺癌的病例-對(duì)照研究或臨床特征描述;對(duì)肺癌和COPD可能具有的
6、共同環(huán)境病因和基因易感位點(diǎn)的認(rèn)識(shí),也都來(lái)自于各自獨(dú)立的疾病研究;肺癌的關(guān)聯(lián)研究中往往忽視了對(duì)COPD效應(yīng)的分析。因此,本研究通過(guò)在廣州、蘇州兩中心,同時(shí)進(jìn)行肺癌病例與對(duì)照、COPD病例與對(duì)照的平行研究,(1)揭示肺癌與COPD的共同環(huán)境危險(xiǎn)因素,評(píng)價(jià)COPD在這些共同病因致肺癌發(fā)生中的中介效應(yīng);(2)沿著“受體→信號(hào)傳導(dǎo)途徑→轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子→氧化應(yīng)激、DNA損傷和EMT→肺部疾病”的研究思路,分析了尼古丁受體家族、氧化還原酶WWOX和EM
7、T調(diào)控基因的遺傳變異【包括單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)和拷貝數(shù)變異(copynumber variation,CNV)】與肺癌和COPD發(fā)病及預(yù)后的關(guān)聯(lián),并探索陽(yáng)性關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的生物學(xué)功能,闡述肺癌與COPD的共同遺傳易感分子。以期從基因和環(huán)境以及基因-環(huán)境交互效應(yīng)層面揭示肺癌與COPD的共同發(fā)病機(jī)制,從而為兩病的預(yù)防與控制提供新的思路和科學(xué)依據(jù)。
第一部分:肺癌與COPD的共
8、同病因及COPD中介效應(yīng)分析
肺癌與COPD的關(guān)系極為密切。既往多個(gè)流行病學(xué)研究顯示兩者環(huán)境病因譜有廣泛的重疊,如吸煙、被動(dòng)吸煙、職業(yè)暴露、肺部疾病史等。然而當(dāng)前對(duì)肺癌和COPD環(huán)境病因的研究都是獨(dú)立開(kāi)展的,地區(qū)、時(shí)間和種族間的異質(zhì)性讓我們很難比較這些病因在肺癌和 COPD的效應(yīng)差異,且目前仍未有研究系統(tǒng)化地闡述兩者的共同病因。另外,近期國(guó)外有研究發(fā)現(xiàn)COPD在吸煙導(dǎo)致的肺癌危險(xiǎn)效應(yīng)中起著中介作用。其他病因亦可能在致肺癌的過(guò)程
9、中起著類似效應(yīng),但尚未有研究報(bào)道。
目的:
揭示肺癌與COPD的共同環(huán)境病因譜及評(píng)價(jià)COPD在肺癌發(fā)病中的中介效應(yīng),分析肺癌和COPD的外在聯(lián)系,為兩病的綜合預(yù)防提供科學(xué)依據(jù)。
方法:
在廣州和蘇州兩地開(kāi)展肺癌和COPD獨(dú)立的病例-對(duì)照研究。其中,肺癌的研究包括廣州地區(qū)肺癌病例1056例和正常健康對(duì)照1056例,蘇州地區(qū)肺癌503例和對(duì)照623例;COPD的研究包括廣州地區(qū)COPD病例1025例和
10、肺功能正常對(duì)照1061例,蘇州地區(qū)COPD病例486例和對(duì)照616例。對(duì)照皆按與病例性別相同、年齡(±5歲)以頻率配比的方法,從參加健康體檢項(xiàng)目的人群中進(jìn)行隨機(jī)選擇。問(wèn)卷收集個(gè)體特征和環(huán)境暴露等22個(gè)項(xiàng)目信息。采用SAS9.3軟件進(jìn)行多因素logistic回歸模型分析,揭示肺癌和 COPD的共同環(huán)境暴露因素。利用無(wú)順序多變量 Logistic回歸模型和Sobel檢驗(yàn)評(píng)價(jià)COPD在共同因素致肺癌發(fā)病過(guò)程中的中介效應(yīng)。
結(jié)果:
11、r> 肺結(jié)核史、肺氣腫史、吸煙(或吸煙量)、被動(dòng)吸煙、職業(yè)接觸金屬毒物、住房通風(fēng)差、使用生物燃料和少食蔬菜水果8項(xiàng)暴露因素能顯著增加肺癌和COPD的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),其危險(xiǎn)效應(yīng)方向一致。進(jìn)一步的無(wú)順序多變量Logistic回歸模型顯示,吸煙和使用生物燃料對(duì)COPD人群發(fā)生肺癌風(fēng)險(xiǎn)的增加效應(yīng)(吸煙:OR=3.13;生物燃料:OR=2.99)顯著高于非COPD人群(吸煙:OR=1.31;生物燃料:OR=1.34)(P值分別為4.53×10-6和8
12、.42×10-5),且COPD在吸煙和生物燃料的致肺癌發(fā)病效應(yīng)中具有顯著的中介作用,分別占據(jù)總效應(yīng)的13.1%和6.1%(Sobel檢驗(yàn):P值分別為0.005和0.039)。
結(jié)論:
肺癌與 COPD的環(huán)境病因譜存在廣泛的重疊。COPD在吸煙和生物燃料的致肺癌效應(yīng)中具有中介效應(yīng),提示吸煙者和生物燃料使用者傾向于先發(fā)生COPD再發(fā)展為肺癌,這為肺癌和COPD的人群預(yù)防提供了新的思路。
第二部分:肺癌與COPD
13、的共同遺傳易感性研究
第一節(jié)尼古丁受體3(CHRNA3)基因遺傳變異與肺癌和COPD發(fā)病及預(yù)后的關(guān)系
人類15號(hào)染色體長(zhǎng)臂24區(qū)(15q24)是已明確的肺癌和COPD的易感基因區(qū)段,位于該區(qū)域內(nèi)的尼古丁受體家族基因簇(CHRNA3-CHRNB4-CHRNA5)上的多個(gè)遺傳變異被報(bào)道與肺癌、COPD、肺功能和吸煙行為存在顯著關(guān)聯(lián)。我國(guó)人群的研究同樣報(bào)道了該區(qū)域還存在一個(gè)功能性的SNP rs6495309,其與肺癌發(fā)病和
14、吸煙行為密切相關(guān),但我國(guó)人群尚未有研究進(jìn)行上述基因變異與COPD發(fā)病關(guān)聯(lián)的探索。此外,吸煙可影響肺癌及 COPD的預(yù)后,這些 SNPs極有可能通過(guò)介導(dǎo)吸煙行為而影響肺癌或COPD的預(yù)后。因此,我們假設(shè)位于人類15q24區(qū)上的多態(tài)位點(diǎn)可能與我國(guó)人群肺癌和COPD的發(fā)病及預(yù)后相關(guān)。
目的:
分析人類15q24區(qū)上的SNPs在我國(guó)人群肺癌和COPD發(fā)生、發(fā)展中的作用。
方法:
利用連鎖不平衡分析(Lin
15、kage disequilibrium,LD)于GWAS報(bào)道的關(guān)聯(lián)SNPs中篩選出CHRNA3基因上兩個(gè)功能性的SNPs(rs6495309T>C和rs1051730G>A),通過(guò)PCR-RFLP的方法檢測(cè)前述人群的兩SNPs的基因型,用多因素logistic回歸模型和Log-Rank檢驗(yàn)以及Cox回歸模型分別評(píng)估兩SNPs與疾病發(fā)病和預(yù)后關(guān)聯(lián)。針對(duì)陽(yáng)性關(guān)聯(lián)位點(diǎn)rs6495309T>C,構(gòu)建螢光素酶報(bào)告基因系統(tǒng),分析T等位基因與C等位基
16、因的轉(zhuǎn)錄活性,并通過(guò)毒理學(xué)實(shí)驗(yàn),檢測(cè)兩等位基因?qū)煵菽铩⒛峁哦?、煙草亞硝胺(NNK)和苯并芘(BaP)刺激的敏感性差異。
結(jié)果:
rs6495309T>C與肺癌的關(guān)聯(lián)符合顯性遺傳模型,rs6495309C變異基因型(CC+TT)能顯著增加肺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.57,95%CI=1.31-1.87),縮短肺癌患者的生存期,增加肺癌患者的死亡風(fēng)險(xiǎn)(HR=1.41,95%CI=1.13-1.75);其與COPD的關(guān)
17、聯(lián)符合隱形遺傳模型,CC基因型能顯著增加 COPD的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.32,95%CI=1.14-1.54),加快肺功能下降,且與 COPD進(jìn)展呈顯著正相關(guān)(P=0.033)。rs6495309T>C變異還與吸煙行為存在顯著的交互效應(yīng)。體外實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),相較T等位基因,攜帶C等位基因的啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄活性更高,煙草凝集物和尼古丁刺激能顯著擴(kuò)大兩等位基因之間的活性差異。而 rs1051730G>A與肺癌和 COPD的發(fā)病及預(yù)后的關(guān)聯(lián)皆沒(méi)有顯著性。
18、
結(jié)論:
CHRNA3基因SNP rs6495309C變異可顯著增加其基因的轉(zhuǎn)錄活性,提高機(jī)體細(xì)胞對(duì)毒物的敏感性,且與吸煙存在基因-環(huán)境交互效應(yīng),使得人群攜帶者對(duì)肺癌和COPD更為易感,病患攜帶者的肺癌和COPD預(yù)后更差。
第二節(jié)尼古丁受體7(CHRNA7)基因拷貝數(shù)變異與我國(guó)人群肺癌和COPD發(fā)病及預(yù)后的關(guān)聯(lián)研究
拷貝數(shù)變異(CNV)是基因組內(nèi)廣泛存在的一種較大片段的遺傳變異,指的是1 kb以上
19、基因組大片段的拷貝數(shù)增加或者減少。相較單個(gè)位點(diǎn)核苷酸(SNP)的變化,CNV更易于引起基因的結(jié)構(gòu)異常和表達(dá)水平的變化,從而影響疾病的發(fā)生與發(fā)展??梢灶A(yù)見(jiàn),位于疾病易感基因上的 CNVs極有可能影響人群疾病易感性。由此,我們假設(shè)位于尼古丁受體基因上的 CNVs可影響尼古丁基因功能而與我國(guó)人群肺癌和COPD發(fā)生、發(fā)展相關(guān)。
目的:
探索尼古丁受體家族基因拷貝數(shù)變異與肺癌和COPD的發(fā)病及預(yù)后的關(guān)系,闡明其生物學(xué)機(jī)制。
20、r> 方法:
參考基因組變異數(shù)據(jù)庫(kù)(Database of Genomic Variants,DGV),從11個(gè)神經(jīng)性尼古丁受體家族基因(CHRNA2、CHRNA3、CHRNA4、CHRNA5、CHRNA6、CHRNA7、CHRNA9、CHRNA10、CHRNB2、CHRNB3和 CHRNB4)中選取中國(guó)人群拷貝數(shù)變異頻率>5%的拷貝數(shù)變異,分別為CHRNA7基因的CNV-3956和CHRNA10基因的CNV-3833。在前
21、期病例-對(duì)照研究的基礎(chǔ)上,利用中通量Accucopy法進(jìn)行初步檢測(cè),篩選潛在的陽(yáng)性關(guān)聯(lián)位點(diǎn),進(jìn)而用Taqman實(shí)時(shí)定量技術(shù)進(jìn)行大樣本的基因型鑒定。進(jìn)一步在肺組織中檢測(cè)CHRNA7基因的表達(dá)水平,分析基因型-表型的關(guān)聯(lián)。
結(jié)果:
CHRNA7基因CNV-3956與肺癌的關(guān)聯(lián)符合隱性遺傳模型,攜帶4-copy基因型個(gè)體的肺癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)是攜帶2、3-copy基因型個(gè)體的1.49倍( OR=1.49,95%CI=1.29-1.
22、73);且4-copy基因型肺癌患者肺癌生存期顯著短于后者(中位生存期:11月vs.14月;HR=1.25,95%CI=1.07-1.45);CNV-3956與COPD的關(guān)聯(lián)符合顯性遺傳模型,相較2-copy基因型攜帶者,3/4-copy基因型攜帶者發(fā)生COPD的風(fēng)險(xiǎn)增加了45%(OR=1.45,95%CI=1.26-1.66),第一秒用力呼氣量(pre-Forced expiratory volume in one second,pr
23、e-FEV1)更低(P=1.46×10-5),且 FEV1值下降的更快(-0.113±0.156 vs.-0.078±0.099;t檢驗(yàn):P=0.034)。此外,CNV-3956與吸煙在增加肺癌和COPD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)上有顯著的交互作用。進(jìn)一步分析CNV-3956拷貝數(shù)與吸煙量關(guān)系發(fā)現(xiàn)其與吸煙包年數(shù)成正相關(guān)(P=4.00×10-4)。
在肺癌組織中,CNV-3956拷貝數(shù)與CHRNA7基因mRNA和蛋白質(zhì)水平呈顯著正相關(guān)(mRNA:
24、P=0.049;蛋白質(zhì):P=0.013)。本研究未發(fā)現(xiàn)CHRNA10基因CNV-3833與肺癌或COPD的發(fā)病或預(yù)后存在顯著關(guān)聯(lián)。
結(jié)論:
CHRNA7基因拷貝數(shù)變異CNV-3956可改變其基因表達(dá),影響吸煙者吸煙量,從而改變肺癌和COPD發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)及預(yù)后,它可能是一個(gè)潛在的生物標(biāo)志物,用于預(yù)測(cè)肺癌和COPD的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)和預(yù)后評(píng)價(jià)。
第三節(jié) EMT調(diào)控子Snai1基因外顯子Val118Ala變異能降低我國(guó)人群
25、肺癌和COPD的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)
上皮細(xì)胞間質(zhì)性轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)是指上皮細(xì)胞轉(zhuǎn)分化為間質(zhì)性細(xì)胞。近年來(lái),大量研究提示EMT可促進(jìn)肺癌和COPD的發(fā)生發(fā)展。GWAS亦報(bào)道了EMT相關(guān)基因的遺傳變異與肺癌和COPD的發(fā)病相關(guān)。在機(jī)體內(nèi),EMT主要由多個(gè)核內(nèi)轉(zhuǎn)錄因子即EMT調(diào)控子所調(diào)控,這些分子發(fā)揮控制EMT過(guò)程的“開(kāi)關(guān)”效應(yīng),可以下調(diào)上皮細(xì)胞標(biāo)志物的表達(dá),并上調(diào)間質(zhì)細(xì)胞標(biāo)志
26、物的表達(dá)。目前,已有多個(gè)EMT調(diào)控子被報(bào)道。其中,鋅指蛋白家族的Snai1和Slug,E盒結(jié)合鋅指蛋白Zeb1和Zeb2,以及基本螺旋環(huán)螺旋因子Twist1受到廣泛關(guān)注。因此,我們假設(shè)位于 EMT調(diào)控子基因上的潛在功能性多態(tài)可能通過(guò)單獨(dú)或聯(lián)合效應(yīng)影響EMT的過(guò)程,最終導(dǎo)致肺癌或COPD易感。
目的:
探究與肺癌和COPD發(fā)生發(fā)展相關(guān)的EMT調(diào)控分子的潛在功能性SNPs,并探明其生物學(xué)機(jī)制。
方法:
27、 參考dbSNP數(shù)據(jù)庫(kù),針對(duì)Snai1,Slug,Zeb1,Zeb2和Twist1這5個(gè)主要的EMT調(diào)控子,選取位于各編碼基因啟動(dòng)子區(qū)(上游-2000bp)、5’-非翻譯區(qū)、外顯子區(qū)和3’-非翻譯區(qū)的常見(jiàn)(低發(fā)等位基因頻率>5%)潛在功能性多態(tài)位點(diǎn),共7個(gè)SNPs,以Taqman基因分型技術(shù)檢測(cè)各SNP的基因型。針對(duì)所發(fā)現(xiàn)的陽(yáng)性關(guān)聯(lián)位點(diǎn),Snai1基因外顯子變異(Val118Ala),構(gòu)建含不同等位基因的pcDNA3.1表達(dá)載體,轉(zhuǎn)染人
28、肺細(xì)胞系A(chǔ)549和16HBE,鏡下觀察細(xì)胞形態(tài)變化,利用劃痕實(shí)驗(yàn)、Transwell實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞遷移和侵襲能力,采用熒光定量PCR和Western blot法檢測(cè)受Snai1轉(zhuǎn)錄調(diào)控的EMT標(biāo)志分子E鈣粘著蛋白(E-cadherin,CDH1)、纖連蛋白(Fibronectin,F(xiàn)N)和波形蛋白(Vimentin,VIM)的表達(dá),分析攜帶不同118位氨基酸的Snai1蛋白的轉(zhuǎn)錄調(diào)控能力和促EMT效應(yīng)差異。
結(jié)果:
V
29、al118Ala變異與肺癌和COPD的發(fā)病顯著相關(guān),相較于118Ala純合基因型攜帶者,118Val雜合基因型和純合基因型攜帶者發(fā)生肺癌的風(fēng)險(xiǎn)下降24%(OR=0.76,95%CI=0.65-0.90),發(fā)生COPD的風(fēng)險(xiǎn)下降了22%(OR=0.78,95%CI=0.65-0.93);118Val基因型降低肺癌風(fēng)險(xiǎn)的效應(yīng)在COPD人群中更顯著(P=0.001);Val118Ala還與肺癌吸煙患者的腫瘤分期相關(guān)(P=0.013),118A
30、la變異基因型能顯著降低吸煙患者腫瘤發(fā)生轉(zhuǎn)移的概率。體外功能實(shí)驗(yàn)表明,過(guò)表達(dá) Snai1-118Ala蛋白的細(xì)胞,其遷移和侵襲能力及間質(zhì)化細(xì)胞特征皆弱于過(guò)表達(dá)Snai1-118Val的細(xì)胞;Snai1-118Ala上調(diào)間質(zhì)細(xì)胞標(biāo)志物FN和Vim的幅度顯著低于Snai1-118Val,但兩者對(duì)上皮標(biāo)志物E-cad表達(dá)的調(diào)控?zé)o顯著性差異。此外,本研究未發(fā)現(xiàn)其他EMT調(diào)控子的SNPs與肺癌或COPD的發(fā)病及預(yù)后有顯著關(guān)聯(lián)。
結(jié)論:<
31、br> EMT調(diào)控子Snai1基因外顯子Val118Ala的遺傳變異能影響該基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控能力,延緩肺上皮細(xì)胞的間質(zhì)型轉(zhuǎn)化,從而降低肺癌和COPD的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),其對(duì)肺癌的保護(hù)效應(yīng)在COPD人群中更為顯著。
第四節(jié)氧化還原酶WWOX基因拷貝數(shù)變異影響我國(guó)人群肺癌和COPD的易感性
氧化應(yīng)激(Oxidative Stress)是指體內(nèi)氧化與抗氧化作用失衡,產(chǎn)生過(guò)氧化物和氧自由基,導(dǎo)致中性粒細(xì)胞炎性浸潤(rùn),損傷機(jī)體細(xì)胞成分如
32、DNA。氧化應(yīng)激參與肺癌和 COPD的發(fā)生發(fā)展。近期一項(xiàng)在歐洲人群開(kāi)展的 GWAS發(fā)現(xiàn),位于編碼 WW結(jié)構(gòu)域氧化還原酶(WWOX)基因上的遺傳變異(rs12716852)與肺功能有顯著關(guān)聯(lián),而我們前期研究也發(fā)現(xiàn)該基因SNPs與我國(guó)人群的肺癌發(fā)病相關(guān),提示該基因可能是肺癌和 COPD共有的易感基因。WWOX基因位于人類染色體普通脆性位點(diǎn)FRA16D(16q23~16q24.1)內(nèi),該區(qū)域存在大量的拷貝數(shù)變異(CNVs)。這些拷貝數(shù)變異極有
33、可能影響WWOX的基因結(jié)構(gòu)或表達(dá),從而與人群肺癌或COPD的易感性相關(guān)。因此,我們假設(shè)位于 WWOX基因上的 CNVs可影響我國(guó)人群的肺癌和COPD易感性。
目的:
研究氧化還原酶WWOX基因拷貝數(shù)變異與我國(guó)人群肺癌和COPD發(fā)病的關(guān)聯(lián)。
方法:
利用 Taqman實(shí)時(shí)定量技術(shù)檢測(cè)前述人群 WWOX基因常見(jiàn)的拷貝數(shù)變異CNV-67048,應(yīng)用ACCUCOPY assay和Affymetrix Ge
34、nome-Wide HumanSNP Array6.0芯片驗(yàn)證 Taqman技術(shù)結(jié)果檢測(cè)的準(zhǔn)確性。對(duì) WWOX進(jìn)行轉(zhuǎn)錄子測(cè)序,分析CNV-67048與WWOX外顯子缺失的關(guān)系,并采取real-timePCR、western blot實(shí)驗(yàn)檢測(cè)肺組織內(nèi)WWOX基因的mRNA和蛋白表達(dá)水平,分析基因型-表型關(guān)聯(lián),以揭示該遺傳變異的生物學(xué)功能。
結(jié)果:
CNV-67048拷貝數(shù)變異與肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)呈顯著的劑量-效應(yīng)關(guān)系(Ptr
35、end=1.12×10-10)。與野生2-copy基因型攜帶者比較,缺失基因型(1-拷貝或者0-拷貝)攜帶者發(fā)生肺癌的風(fēng)險(xiǎn)上升了40%(OR=1.40,95%CI=1.20-1.63)。CNV-67048基因型為缺失型的肺癌組織,其發(fā)生 WWOX外顯子6-8缺失的概率也顯著增加(P=0.021),其WWOX基因的表達(dá)水平也顯著低于2-copy基因型組織(P<0.05)。此外,該遺傳變異同樣與 COPD的發(fā)病相關(guān),缺失基因型(1-拷貝或者
36、0-拷貝)攜帶者發(fā)生 COPD的風(fēng)險(xiǎn)是2-copy野生基因型攜帶者的1.30倍( OR=1.30,95%CI=1.12-1.50)。
結(jié)論:
WWOX基因缺失型拷貝數(shù)變異CNV-67048與我國(guó)人群發(fā)生肺癌和COPD的易感性存在顯著關(guān)聯(lián)。其生物學(xué)機(jī)制可能是缺失型CNV-67048可增加WWOX發(fā)生外顯子6-8缺失的概率,導(dǎo)致WWOX表達(dá)低下或不表達(dá),進(jìn)而引起機(jī)體的氧化修復(fù)能力異常,從而促進(jìn)肺癌和 COPD的共同發(fā)病。
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