GATA4基因在漢族房室隔缺損患者中的突變分析及功能分析.pdf_第1頁(yè)
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1、目的:通過(guò)檢測(cè)心臟發(fā)育中的重要轉(zhuǎn)錄因子GATA4基因在房室隔缺損(AVSD)患者中的突變情況以及應(yīng)用生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)突變點(diǎn)對(duì)蛋白功能的影響,探討其在先天性房室隔缺損發(fā)病機(jī)制中的作用。
   方法:收集61例漢族AVSD患者和100例漢族正常人對(duì)照組的血液標(biāo)本,應(yīng)用PCR方法擴(kuò)增GATA4基因6個(gè)編碼外顯子的序列和兩側(cè)各50個(gè)堿基以上序列,并對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序。將患者擴(kuò)增的GATA4基因編碼序列與GenBank人GATA4基因編

2、碼序列進(jìn)行比對(duì),并與正常人對(duì)照組比較,觀察GATA4突變情況。采用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法比較在AVSD合并21-三體綜合征與非合并21-三體綜合征的患者中檢出GATA4的突變率有無(wú)差異。利用生物信息學(xué)的方法(SIFT)預(yù)測(cè)基因突變可能對(duì)GATA4蛋白功能的影響。
   結(jié)果:
   1.在61例患者(包括合并21-三體綜合征7例,非綜合征病例54例)中檢出2例錯(cuò)義突變(堿基變化為C106G、A1129G,氨基酸改變分別為P36A、S

3、377G),兩例均為非21-三體綜合征AVSD患者。
   2.GATA4基因編碼第36 位脯氨酸和第377位絲氨酸在生物進(jìn)化過(guò)程中均處于高度保守。
   3.GATA4突變率在AVSD合并21-三體綜合征(0/7)與非合并21-三體綜合征(2/54)的患者中的比較,采用Fisher’s確切概率法,P=0.782(P>0.05),兩組突變率的差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
   4.利用SIFT程序預(yù)測(cè)GATA4基因P36A

4、點(diǎn)突變概率P值是0.00(P<0.05),S377G點(diǎn)突變概率P值是0.63(P>0.05)。
   結(jié)論:
   1.本實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)的兩例錯(cuò)義突變,僅存在于AVSD患者中,在對(duì)照組中不存在,提示GATA4的基因突變可能與AVSD發(fā)病相關(guān)。
   2.合并21-三體綜合征與非合并21-三體綜合征的AVSD患者GATA4檢出的突變率無(wú)明顯差異。
   3.GATA4基因在AVSD患者中突變率低,提示AVSD可能

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