結核分枝桿菌Rv3627c基因的克隆表達與功能分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、結核分枝桿菌的細胞壁是維持其生長和增殖的重要結構,主要由分枝菌酸、阿拉伯聚糖半乳聚糖和肽聚糖(mycolic acid-arabinogalactan-petidoglycan,mAGP)三部分組成,其中肽聚糖是細菌生長所必需的。青霉素結合蛋白(penicillin binding proteins,PBPs)參與肽聚糖的合成和維護,因此,鑒定結核分枝桿菌中的青霉素結合蛋白,有助于了解肽聚糖的代謝機理。 我們通過生物信息學的方法

2、和細菌之間的相似性預測結核分枝桿菌基因組中的Rv3627c基因的表達產(chǎn)物為可能的PBPs,其結構兩次跨膜,并且可能具有羧肽酶或內肽酶的活性,參與肽聚糖的重建和多肽鏈之間的交聯(lián),有可能成為新的潛在的抗結核藥物作用靶點。為了分析結核分枝桿菌中基因Rv3627c的功能,我們設計此課題進行研究:首先克隆結核分枝桿菌的Rv3627c基因,然后分別在大腸桿菌BL21(DE3)、C41(DE3)和恥垢分枝桿菌(Mycobacterium smegma

3、tis,Sm)中表達重組蛋白,并設計酶促反應分析該蛋白質的功能。 目的:(1)通過PCR的方法從結核分枝桿菌H37Rv菌株的基因組DNA中擴增出Rv3627c基因;(2)分別構建pET29b-Rv3627c和pVV16-Rv3627c表達載體;(3)分別在大腸桿菌BL21(DE3)、C41(DE3)和恥垢分枝桿菌mc2155中表達Rv3627c蛋白;(4)分析Rv3627c蛋白是否具有羧肽酶活性。 結果: 1.R

4、v3627c基因的克隆 從結核分枝桿菌H37Rv菌株基因組數(shù)據(jù)庫(http://genolist.pasteur.fr/TubercuList/)中獲得Rv3627c基因的核苷酸序列(1395 bp)。根據(jù)其核苷酸序列設計上下游PCR引物,并分別在其上游引物和下游引物的5’端引入了NdeⅠ和XhoⅠ限制性酶切位點。以H37Rv菌株基因組DNA為模板擴增出了Rv3627c基因。 將Rv3627c基因克隆到pMD18載體,并

5、對Rv3627c進行DNA序列測定。結果顯示所克隆的Rv3627c基因與H37Rv菌株基因組數(shù)據(jù)庫中Rv3627c基因的核苷酸序列完全一致,說明在本次實驗中通過PCR的方法獲得的Rv3627c基因為正確擴增的基因,無堿基突變。 2.pET29b-Rv3627c的構建及Rv3627c蛋白在大腸桿菌中的表達 用NdeⅠ和XhoⅠ雙酶切pMD-Rv3627c,將Rv3627c基因克隆到表達載體pET29b。在pET29b-Rv

6、3627c中,Rv3627c蛋白的C端與質粒上的組氨酸標簽形成融合蛋白。 用pET29b-Rv3627c質粒轉化到大腸桿菌BL21(DE3),并加入IPTG誘導表達重組蛋白。用SDS-PAGE鑒定了誘導表達的Rv3627c蛋白。 用pET29b-Rv3627c質粒轉化到大腸桿菌C41(DE3)的感受態(tài)細胞,用0.1 mM IPTG在37℃誘導C41(DE3)/pET29b-Rv3627c細菌3小時。超聲破碎細菌后對上清和

7、沉淀組分進行SDS-PAGE分析,結果表明Rv3627c蛋白在大腸桿菌C41(DE3)中被誘導表達。通過組氨酸-Ni2+親和層析技術純化Rv3627c蛋白,對純化的Rv3627c蛋白進行定量(考馬斯亮藍法),第1洗脫組分中Rv3627c蛋白濃度為1.03 mg/ml,并通過SDS-PAGE鑒定純化的Rv3627c蛋白。 3.pVV16-Rv3627c表達載體的構建及Rv3627c蛋白在恥垢分枝桿菌mc2155中的表達 用

8、NdeⅠ和HindⅢ雙酶切pMD-Rv3627c,將Rv3627c基因克隆到表達載體pVV16。用pVV16-Rv3627c表達載體電轉化mc2155感受態(tài)細胞。挑選6個單菌落接種到5 ml含Kan(25mg/ml)和Tween80(終濃度0.05%)的LB液體培養(yǎng)基中,在37℃振蕩培養(yǎng)72小時,然后大體積培養(yǎng)mc2155p/VV16-Rv3627c細菌。收集、超聲破碎細菌,對上清和沉淀組分進行了SDS-PAGE分析,但無預期的蛋白條帶

9、。 4.Rv3627c蛋白的酶活性分析 提取mc2155p/VV16-Rv3627c及野生型mc2155細胞壁中的胞壁肽作為底物,設計了酶促反應。利用紙層析方法檢測反應生成的產(chǎn)物。通過結果推斷結核分枝桿菌Rv3627c基因表達的蛋白質可能具有羧肽酶活性。 結論:在本次研究中,我們分別構建了pET29b-Rv3627c和pVV16-Rv3627c表達載體,并分別在大腸桿菌BL21(DE3)和C41(DE3)表達了R

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