用DNA芯片鑒定水稻花器官發(fā)育相關(guān)基因.pdf_第1頁(yè)
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1、突變體是研究水稻花器官發(fā)育的一種良好的實(shí)驗(yàn)材料。目前已發(fā)現(xiàn)的水稻花器官突變體還很少,已克隆的與水稻花器官發(fā)育相關(guān)的基因大多數(shù)是采用同源克隆方法分離的。我們利用輻射誘變方法,在日本晴中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)水稻花器官發(fā)育的突變體psd2。psd2植株?duì)I養(yǎng)生長(zhǎng)正常,與野生型植株同步進(jìn)入生殖發(fā)育,但其穎花外型比正常穎花明顯膨大,雄蕊原基和雌蕊原基不分化,產(chǎn)生多重內(nèi)外稃結(jié)構(gòu)。本研究室已經(jīng)證明,psd2的突變性狀是由一個(gè)基因的隱性突變引起的,并對(duì)該基因(記為

2、PSD2)進(jìn)行了精細(xì)定位,確定了候選基因。從突變表現(xiàn)看,PSD2應(yīng)是水稻雌雄蕊發(fā)育的關(guān)鍵基因。該基因的突變,有可能會(huì)引起一系列與水稻花器官發(fā)育相關(guān)的基因的表達(dá)改變。因此,本研究利用cDNA微陣列,對(duì)psd2突變體和野生型在雌雄蕊發(fā)育過(guò)程中差異表達(dá)的基因進(jìn)行了鑒定,以期找出其它與水稻花器官發(fā)育相關(guān)的基因,為深入剖析水稻花器官發(fā)育的基因網(wǎng)絡(luò)奠定基礎(chǔ)。 取雌、雄蕊形成期的psd2突變體和野生型水稻莖尖2~10毫米長(zhǎng)的幼穗,提取總RNA

3、,進(jìn)行cDNA微陣列雜交。接著進(jìn)行芯片掃描,芯片數(shù)據(jù)的提取和分析。按照在采用“psd2+Cy3/PSD2+Cy5”染料標(biāo)記方法的cDNA微陣列實(shí)驗(yàn)中Ratio≥2,且在采用“psd2+Cy5/PSD2+Cy3”染料標(biāo)記方法的Ratio>1的標(biāo)準(zhǔn),我們?cè)趐sd2中檢測(cè)到36個(gè)差異表達(dá)基因,其中24個(gè)表達(dá)上調(diào),12個(gè)表達(dá)下調(diào)。因此,我們通過(guò)cDNA微陣列鑒定,篩選到了36個(gè)花器官發(fā)育相關(guān)基因。 對(duì)這36個(gè)相關(guān)基因進(jìn)行進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn):

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