應(yīng)用基因表達(dá)譜芯片篩選盆腔器官脫垂相關(guān)基因的實驗研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、研究目的: 1.應(yīng)用基因表達(dá)譜芯片,篩選絕經(jīng)后POP患者與正常絕經(jīng)婦女主韌帶組織中差異表達(dá)的基因2.分析差異表達(dá)基因,探討POP發(fā)生的分子機(jī)制 材料和方法: 1.在絕經(jīng)狀態(tài)、年齡、體重指數(shù)、產(chǎn)次等影響POP發(fā)生的重要因素匹配的前提下,選取3例POP與3例無POP對照的子宮主韌帶組織標(biāo)本。 2.組織標(biāo)本行HE染色,Masson's三色染色驗證組織來源,并觀察主韌帶組織形態(tài)結(jié)構(gòu)。 3.Trizol法提

2、取總RNA,并對總RNA進(jìn)行定量、質(zhì)檢。采用RNA擴(kuò)增標(biāo)記法合成生物素標(biāo)記的cRNA,與Human Genome U133 Plus 2.0芯片雜交。 4.用SAM軟件篩選|Score(d)|≥2,F(xiàn)C值大于2或小于0.5的差異表達(dá)基因。用MAS2.0軟件對差異表達(dá)基因進(jìn)行基因功能分類注釋(GO)和代謝通路分析(Pathway)。 5.實時熒光定量PCR驗證DKK1,SFRP1,F(xiàn)ZD5,WNT16,COL1A1的差異表

3、達(dá)。 實驗結(jié)果: 1.標(biāo)本行HE染色、Masson's三色染色觀察,證實為子宮主韌帶組織。POP組女性子宮主韌帶組織中膠原纖維與平滑肌束失去正常的排列,形態(tài)紊亂,可見膠原纖維斷裂,平滑肌束細(xì)碎。 2.提取總RNA經(jīng)定量和電泳檢測,質(zhì)量滿足芯片雜交要求。雜交后芯片的各項檢測參數(shù)均達(dá)到質(zhì)控要求,子宮主韌帶組織與基因表達(dá)譜芯片的雜交模型建立成功。 3.篩選出179個在POP組和對照組之間差異表達(dá)的基因。其中包括

4、20個功能未知的基因。107個基因在POP組中表達(dá)上調(diào),72個基因在POP組中表達(dá)下調(diào)。差異基因涉及多種功能蛋白和代謝通路。其中Wnt信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路變化最顯著。 4.實時熒光定量PCR證實DKK1,SFRP1,F(xiàn)ZD5,WNT16,COL1A1在POP組中表達(dá)明顯升高,與芯片結(jié)果一致。 結(jié)論: 1.POP患者子宮主韌帶組織中膠原纖維與平滑肌束細(xì)碎,排列紊亂。POP中編碼Ⅰ、Ⅲ、Ⅴ型膠原α1鏈蛋白的基因COL1A1、

5、COL3A1、COL5A1的mRNA水平和MMP2的mRNA水平明顯升高,提示POP中膠原合成增加,分解亦增強(qiáng)。說明POP中膠原的合成和分解活躍,可能以分解為主,引起韌帶支持結(jié)構(gòu)功能的改變,導(dǎo)致POP發(fā)病。 2.人類全基因組表達(dá)譜芯片是一種有效的高通量篩選POP差異表達(dá)基因的研究方法。本實驗以|Score(d)|≥2,F(xiàn)C≥2或FC≤0.5為標(biāo)準(zhǔn)篩選出179個在POP組和對照組之間差異表達(dá)的基因。其中包括20個功能未知的基因。1

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