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文檔簡(jiǎn)介
1、分類是數(shù)據(jù)挖掘和機(jī)器學(xué)習(xí)領(lǐng)域的一個(gè)重要問(wèn)題,目的是通過(guò)訓(xùn)練數(shù)據(jù)集構(gòu)建一個(gè)分類器來(lái)預(yù)測(cè)新的實(shí)例類別。近年來(lái),DNA微陣列的發(fā)展為很多領(lǐng)域提供了一種高維數(shù)據(jù),主要應(yīng)用于癌癥診斷和預(yù)測(cè)。跳躍顯露模式(Jumping EmergingPattern,JEP)是一種區(qū)分能力強(qiáng)的特殊模式,在分類方面有很明顯的優(yōu)越性。隨著DNA微陣列和基因模式的快速發(fā)展,本文提出一種基于JEP的癌癥分類算法。為了進(jìn)一步提高癌癥分類準(zhǔn)確率,本文還研究了基于JEP癌癥分
2、類的組合分類算法,這在生物學(xué)、醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有重要的研究?jī)r(jià)值和實(shí)際意義。
本論文主要從基因表達(dá)數(shù)據(jù)的分析著手,其主要工作歸納如下:
一、對(duì)基因表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,DNA微陣列產(chǎn)生的數(shù)據(jù)具有高維性,有很多噪聲,本文采用基于信息熵的離散化方法將連續(xù)屬性離散化,依據(jù)最小長(zhǎng)度原則找出基因的分割點(diǎn),計(jì)算熵值,篩選出分類特征基因。熵值越小,特征基因分類能力越強(qiáng)。這種離散化方法可以有效消除噪聲數(shù)據(jù)的影響。
二、提
3、出一種更具鑒別能力的基因模式,稱為增強(qiáng)跳躍顯露模式(IJEP),這種模式滿足增長(zhǎng)率趨近無(wú)窮大,且任何子集都不是IJEP的條件。提取IJEP的特征基因是通過(guò)基于信息熵的離散化方法獲得,并在計(jì)算信息熵時(shí),通過(guò)引入貝葉斯m-估計(jì)以克服小容量樣本下頻率等于概率的缺陷,從而提高熵的可靠度。
三、用邊界算法挖掘出有效的IJEP。用BORDER-DIFF算法獲得不同的邊界對(duì),再用MBD-LLBORDDER算法產(chǎn)生IJEP。有效的縮短了I
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