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![1487.鐵皮石斛qpcr內(nèi)參基因的篩選及開花相關(guān)基因的表達(dá)分析_第1頁(yè)](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-5/31/14/ec9386ff-6dc3-416e-b305-56728980615b/ec9386ff-6dc3-416e-b305-56728980615b1.gif)
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3、堿、菲類化合物等多種藥用成分,擁有生津益胃、潤(rùn)肺止咳、增強(qiáng)免疫力等功效。對(duì)關(guān)鍵基因進(jìn)行功能研究有助于更好地開發(fā)利用鐵皮石斛,基因的表達(dá)分析則是基因功能研究的一個(gè)重要方面。目前,基因表達(dá)量一般通過熒光定量PCR相對(duì)定量的方法進(jìn)行分析,而穩(wěn)定的內(nèi)參基因是qPCR相對(duì)定量準(zhǔn)確的保障。為了研究鐵皮石斛不同組織中、不同生長(zhǎng)階段中及非生物脅迫條件下的功能基因表達(dá),篩選特定試驗(yàn)條件下的最佳內(nèi)參基因或基因組合是十分必要的。本研究選取了7個(gè)常用的內(nèi)參基因
4、(Act/n、18SrRNA、GAPDH、EFla、TUA、TUB、UBQ)作為候選基因,通過qPCR絕對(duì)定量方法分別比較了鐵皮石斛不同組織中(原球莖、根、莖、葉、花、種子)、不同生長(zhǎng)階段以及非生物脅迫條件下(高溫、低溫和干旱)各候選內(nèi)參基因的表達(dá)差異。隨即對(duì)獲得的數(shù)據(jù)采用三個(gè)內(nèi)參基因穩(wěn)定性評(píng)估軟件geNorm、NormFinder和BestKeeper進(jìn)行分析,最終篩選到特定試驗(yàn)條件下最合適的內(nèi)參基因和內(nèi)參基因數(shù)。在鐵皮石斛不同組織中
5、,geNorm與NormFinder軟件分析結(jié)果較為一致,而Bestkeeper軟件分析的結(jié)果與以上兩種軟件的分析結(jié)果存在差異。geNorm和NormFinder軟件分析得出候選內(nèi)參基因表達(dá)穩(wěn)定性最低者為18SrRNA,最高者為GAPDH。Bestkeeper軟件分析得出候選內(nèi)參基因表達(dá)穩(wěn)定性最低者為TUA,最高者為18SrRNA。此外,依據(jù)geNorm軟件的配對(duì)差異值Vn/n1,確定該試驗(yàn)所需內(nèi)參基因的最佳數(shù)目是3。綜合分析,推薦鐵皮
6、石斛不同組織中最佳內(nèi)參基因組合為EFlaActinGAPDH。在鐵皮石斛不同生長(zhǎng)發(fā)育階段,3個(gè)軟件的分析結(jié)果不盡相同,但3個(gè)軟件分析得出候選內(nèi)參基因表達(dá)穩(wěn)定性最低者均為TUB,結(jié)合geNorm軟件推薦的該試驗(yàn)條件下所需內(nèi)參基因數(shù)目是5,同時(shí)考慮試驗(yàn)成本和實(shí)際可行性,綜合推薦基因組合UBQG么PD日。在高溫(40℃)和低溫(4℃)脅迫條件下,geNorm和Bestkeeper軟件的分析結(jié)果較一致,與NormFinde軟件分析結(jié)果有所不同。
7、geNorm和Bestkeeper軟件分析均得出候選內(nèi)參基因表達(dá)穩(wěn)定性最低者為TUA,最高者為18SrRNA。NormFinder軟件分析得出候選內(nèi)參基因表達(dá)穩(wěn)定性最低者為GAPDH最高者為Actin。結(jié)合geNorm軟件推薦的該試驗(yàn)條件下所需內(nèi)參基因是5,同時(shí)考慮試驗(yàn)成本和實(shí)際可行性,綜合推薦基因組合為TUB18SrRNA。在干旱脅迫條件下,3個(gè)內(nèi)參基因穩(wěn)定性評(píng)估軟件的分析結(jié)果較一致。3個(gè)軟件分析均得出候選內(nèi)參基因表達(dá)穩(wěn)定性最低者為T
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