楊樹VQ基因家族的表達分析及楊樹新內(nèi)參基因的篩選.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、楊樹作為重要的造林綠化速生樹種和生物能源樹種,其生長受到干旱、鹽堿等非生物脅迫的制約。因此,研究楊樹抵抗逆境脅迫的調控機理,將對防御楊樹受逆境刺激起著關鍵的指導作用。VQ基因家族是植物體內(nèi)的高度保守的一種蛋白家族,參與植物干旱、鹽堿等逆境的調控,這對于提高楊樹抗逆性有著十分重要的研究價值。挑選一個適合的內(nèi)參基因是提高實時熒光定量PCR實驗數(shù)據(jù)真實性,減小實驗誤差的有效方法,而到目前為止仍未發(fā)現(xiàn)一個適宜多個實驗條件的內(nèi)參基因。
  

2、目前,擬南芥、水稻、葡萄等物種中的VQ基因已經(jīng)被證明參與它們各自的生長發(fā)育及脅迫調控,然而關于楊樹中的VQ基因仍未有報道。因此,在本研究當中對楊樹的VQ基因進行了綜合分析,包括全基因組的鑒定、特征分析和楊樹的VQ基因在鹽和干旱條件下的表達分析。
  在楊樹新內(nèi)參基因的研究當中,首先,利用基因芯片技術篩選出6個新內(nèi)參基因(PtRG1,PtRG2,PtRG3,PtRG4,PtRG5,PtRG6),并與6個傳統(tǒng)內(nèi)參基因(PtUKN1,P

3、tUBQ,Actin,EF1α,18S rRNA,TUA8)同時進行熒光定量實時熒光定量PCR實驗,再利用geNorm,NormFinder和BestKeeper軟件對實驗的數(shù)據(jù)進行分析,以比較這12個基因的表達穩(wěn)定性,從而篩選到合適的內(nèi)參基因。為進一步驗證篩選得到的新內(nèi)參基因的穩(wěn)定性,選擇楊樹VQ基因家族中表達量較高的PtVQ6,PtVQ13,PtVQ37作為目的基因再次進行熒光定量PCR實驗。以下是研究的結果:
  (1)共鑒

4、定出了51個楊樹VQ基因,它們可被劃分為7個亞家族,這些基因分布在楊樹19條染色體中的17條上。
  (2)楊樹VQ基因主要VQ基因主要通過片段復制進行基因擴增。
  (3)從基因結構和蛋白基序的分析中可以發(fā)現(xiàn),每個亞家族中的VQ基因都是相對保守的,且有39個VQ基因沒有內(nèi)含子。
  (4)實時熒光定量PCR實驗結果表明,VQ基因在不同的脅迫下表達量不同。
  (5)本研究篩選了6個穩(wěn)定表達的新內(nèi)參基因PtRG1

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