楊樹、葡萄、擬南芥和水稻W(wǎng)RKYⅢ基因家族比較及表達分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、II摘要WRKYIII基因在植物生長調(diào)節(jié)和抗逆性方面發(fā)揮重要作用。WRKY基因在很多植物中都已經(jīng)被研究報道,然而WRKYIII基因在木本植物楊樹與三個開花植物的代表家系:擬南芥、葡萄和水稻中仍缺乏一個全面的分析。楊樹作為一個大型且多年生的木本植物,與擬南芥、葡萄和水稻相比較有著不同的生命周期,其生長發(fā)育和基因調(diào)控網(wǎng)絡可能更加的復雜。本研究中,主要從染色體位置、系統(tǒng)發(fā)育、基因結(jié)構(gòu)、保守基序、保守的共線性、基因復制等方面四個物種的WRKYI

2、II基因家族進行分析,并對楊樹WRKYIII基因家族進行同義置換率(SynonymoussubstitutionsrateKs)及表達模式分析。通過研究主要獲得以下結(jié)果:1.在楊樹(毛果楊)、葡萄、擬南芥和水稻中確定出WRKYIII基因,盡管這些基因的分布是隨機的,但它們的蛋白相關(guān)理化性質(zhì)是趨向一致的。2.將57個WRKYIII基因序列進行比對并構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,結(jié)果表明這些基因可以被分成四個進化枝(clade1、clade2、clade

3、3和clade4),同時發(fā)現(xiàn)旁系同源基因較多,卻僅含有2對直系同源基(PtrWRKY54VvWRKY42、PtrWRKY30VvWRKY52)。3.基因結(jié)構(gòu)分析結(jié)果表明它們的內(nèi)含子外顯子數(shù)量均不同,有些旁系同源基因的結(jié)構(gòu)也不同,進化時期中發(fā)生了內(nèi)含子外顯的丟失或者獲得事件;基序分析結(jié)果表明進化關(guān)系比較近的蛋白在基序組成模式上相同。4.共線性結(jié)果表明楊樹和葡萄間的復制區(qū)域比擬南芥或水稻間更加的保守,每個物種內(nèi)除了全基因組復制事件還存在其他

4、獨立的重復事件;對楊樹WRKYIII基因進行Ks分析,結(jié)果顯示:PtrWRKYIII所有復制區(qū)塊都是在在單子葉植物與雙子葉植物發(fā)生分歧之后才產(chǎn)生形成的;多數(shù)PtrWRKYIII是通過大規(guī)模復制產(chǎn)生;強烈的純化選擇在維持PtrWRKYIII功能的進化方面發(fā)揮著重要的作用。5.毛果楊(南林95)組織表達模式分析發(fā)現(xiàn)有5個基因(PtrWRKY30、54、55、63、90)在木質(zhì)部中表達量最高;誘導表達模式分析顯示,多數(shù)PtrWRKYIII在被

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