SSR標(biāo)記在馬氏珠母貝系譜鑒定、有效親本估計及性狀關(guān)聯(lián)分析中的應(yīng)用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、馬氏珠母貝(Pinctada martensii)是我國海水珍珠生產(chǎn)的主要貝種,已有40多年的大規(guī)模養(yǎng)殖,但還沒有培育出優(yōu)良的養(yǎng)殖品種,致使養(yǎng)殖群體性狀退化,導(dǎo)致我國海水珍珠質(zhì)量明顯降低、國際競爭力下降。因此加強(qiáng)遺傳育種的基礎(chǔ)研究和分子標(biāo)記輔助育種的應(yīng)用研究,培育出生長快、個體大、育珠性狀好的珍珠貝品種具有重要意義。
  以馬氏珠母貝選育系F3為親本,建立了36個家系,按照常規(guī)技術(shù)進(jìn)行幼體培育和海區(qū)養(yǎng)成。7個月后,隨機(jī)選取4個家系

2、,每個家系取樣30個個體,利用篩選的微衛(wèi)星引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,分析候選家系的遺傳結(jié)構(gòu)和系譜。結(jié)果表明:(1)13個微衛(wèi)星引物在四個家系中共檢測到39個等位基因,每個位點(diǎn)的等位基因數(shù)在2~5之間,四個家系的平均觀測雜合度(Ho)為0.531~0.597,平均期望雜合度(He)為0.474~0.507;(2)根據(jù)子代基因型成功的推斷出四個家系的親本基因型。以標(biāo)記PM142為例,通過子代基因型推斷出3#、4#、5#及10#四個家系雙親的基因型

3、分別為116/112×116/112、122/112×116/112、116/112×112/103、122/112×116/112,隨著標(biāo)記數(shù)量的增多,可據(jù)此鑒別各個家系;用UPGMA法對120個樣本進(jìn)行聚類分析,98.3%的同一家系的子代個體能夠聚到一起,分類結(jié)果與系譜來源基本一致。結(jié)果說明,這四個家系具有較高的遺傳多樣性,但家系間己出現(xiàn)明顯的遺傳分化。由于此方法首次成功應(yīng)用在珍珠貝,為該物種群體系譜分析提供了一種新的便捷途徑。

4、r>  從快速生長系F3選擇親本進(jìn)行群體繁殖,雌雄親本數(shù)量分別為42和38個,人工解剖受精,按照常規(guī)技術(shù)進(jìn)行幼體培育和海區(qū)養(yǎng)殖。從子代隨機(jī)選取90個幼體,利用45對微衛(wèi)星標(biāo)記進(jìn)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,分析其遺傳結(jié)構(gòu)和有效親本數(shù)量。結(jié)果共檢測到45個微衛(wèi)星位點(diǎn),186個等位基因,每個位點(diǎn)的等位基因數(shù)在2~9之間,平均每個位點(diǎn)有4.13個等位基因。平均觀察雜合度為0.543;平均Shannon多樣性指數(shù)為1.012;平均PIC值為0.491。根據(jù)基

5、因頻率的似然率算法成功的推斷出該群體含有30個全同胞家系,有效親本數(shù)量為60個,有75%的親本參與了繁殖。世代之間近交系數(shù)增量△F=0.83%,F(xiàn)4代群體的近交系數(shù)F=3.27%。本研究結(jié)果說明:(1)該選系F4具有較高的遺傳變異;(2)本實驗是人工解剖受精,在此情況下精子與卵子混合均勻但是有效親本數(shù)量沒有達(dá)到100%,推其原因可能為某些親本間近交導(dǎo)致后代存活率降低。
  利用本實驗室自主開發(fā)的50個馬氏珠母貝EST-SSR標(biāo)記,

6、對馬氏珠母貝F4代快速生長選育群體的90個個體基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,然后使用統(tǒng)計軟件SPSS對50個微衛(wèi)星標(biāo)記與馬氏珠母貝總重、殼長、殼高、殼寬和韌帶長相關(guān)性進(jìn)行了方差分析。結(jié)果顯示,共有18個微衛(wèi)星標(biāo)記與馬氏珠母貝的5個生長性狀相關(guān),其它32個標(biāo)記對性狀的影響未達(dá)到顯著水平。研究發(fā)現(xiàn)9個標(biāo)記與總重顯著相關(guān)(p<0.05);12個標(biāo)記與殼長顯著相關(guān),其中3個是極顯著相關(guān);14個位點(diǎn)與殼高顯著相關(guān),其中3個為極顯著相關(guān);6個位點(diǎn)和殼

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