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![玉米泛素延伸蛋白ZmERD16的基因克隆與功能分析.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/9/87d189a3-eec9-4ae8-9522-bad0dcae7514/87d189a3-eec9-4ae8-9522-bad0dcae75141.gif)
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文檔簡介
1、玉米是重要的糧、經(jīng)、飼兼用作物。在世界糧食作物中其種植面積和總產(chǎn)鼙已超過水稻和小麥,處于所有作物之首。低溫、干旱、鹽堿等逆境條件嚴(yán)重影響玉米的質(zhì)量和產(chǎn)量,其中水分脅迫是影響玉米產(chǎn)量最主要非生物脅迫因素之一。近年來研究發(fā)現(xiàn),許多受水分脅迫影響的植物基因在響應(yīng)多種脅迫中發(fā)揮著重要作用。發(fā)掘抗旱相關(guān)基因及研究抗旱基因在植物逆境信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中的調(diào)控作用。對于提高水分利用率,節(jié)省水資源,減少干旱危害,實現(xiàn)可持續(xù)發(fā)展,具有重要的現(xiàn)實意義。
2、 ERD(early responsive to dehydration)基因是一類對水分脅迫做出快速應(yīng)答的基因。Kiyosue等最先在擬南芥水分脅迫1小時后分離到16個ERD基因全長cDNA序列,其中包括一個泛素延伸蛋白AtERD16。泛素延伸蛋白可通過降解異常的蛋白而對植物細(xì)胞起保護作用。本研究以抗旱玉米自交系CN165為試材,克隆玉米中與擬南芥AtERD16基因序列同源的泛素延伸蛋白基因,命名為ZmERD16。通過生物信息學(xué)手段預(yù)
3、測該基因結(jié)構(gòu)和序列特點:采用實時熒光定量PCR方法對ZmERD16進行表達(dá)譜分析;通過農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化擬南芥對其進行功能的初步研究。
主要研究結(jié)果如下:
1.ZmERD16基因的克隆應(yīng)用同源克隆技術(shù)從抗旱玉米自交系CN165中得到1個泛素延伸蛋白序列,與AtERD16基因序列高度相似,命名為ZmERD16。同時利用PCR方法得到了ZmERD16的基因組DNA序列3252bp和其上游啟動子序列2190bp。
4、 2.ZmERD16的序列分析在線分析表明ZmERD16的開放閱讀框為390bp,編碼129個氨基酸,等電點pI為9.94,分子量為14.7582KD。ZmERD16蛋白包含1個泛素單體蛋白,其后融合了一個53個氨基酸的核糖體多肽,屬于ubiquitin/L40泛素延伸蛋白亞族。ZmERD16具有由4個外顯子3個內(nèi)含子構(gòu)成的基因組結(jié)構(gòu)。
3.同源性比對和進化樹分析ZmERD16蛋白與其他真核生物中的ubiquitin/
5、L40泛素延伸蛋白序列具有高度同源性。聚類分析將所聚類的植物分為單子葉植物、雙子葉植物和綠藻3類,此結(jié)果與生物進化有高度的相關(guān)性。
4.亞細(xì)胞定何利用綠色熒光蛋白(GFP)融合蛋白技術(shù)來進行洋蔥表皮實驗,將ZmERDl6定位于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中。
5.順式作用元件分析該基因的啟動子區(qū)域具有多個光應(yīng)答、發(fā)育、激素、干旱、病害防御、真菌等脅迫應(yīng)答元件。
6.ZmERD16的表達(dá)譜分析利用實時熒光定量P
6、CR對ZmERD16的組織特異性和在不同脅迫條件下的表達(dá)譜進行分析,結(jié)果顯示ZmERD16在正常生長條件下玉米的雌穗、雄穗、幼胚、花絲、穗位葉、幼葉和根中均具有一定量的積累:ZmERD16受鹽、脫水、PEG、低溫、高溫、茉莉酸甲酯和水楊酸等多種脅迫的誘導(dǎo)表達(dá),而不受ABA和類生長素處理誘導(dǎo)表達(dá)。
7.ZmERD16基因轉(zhuǎn)化野生型擬南芥ZmERD16過表達(dá)影響了擬南芥的生長發(fā)育,轉(zhuǎn)基因株系的幼苗比野生型的幼苗明顯要小,且轉(zhuǎn)基
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