豫谷一號BAC文庫的構(gòu)建及鑒定.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、谷子(Setaria italica Beauv.),是世界上最古老的農(nóng)作物之一,并且作為一種重要的糧食作物,在我國北方的糧食生產(chǎn)中占有重要地位。谷子具有多種優(yōu)良的農(nóng)藝性狀,目前已經(jīng)證實的性狀如耐旱、耐貧瘠等。隨著人們對更高水平生活的追求,各種營養(yǎng)要素的均衡成為對食品的新的要求。谷子含人體所需的多種氨基酸,最為重要的一點是其所含的不飽和脂肪酸的含量很高,而這有正好是人體智力發(fā)育不可或缺的重要營養(yǎng)成分。我國谷子育種研究起步較晚,它的遺傳研

2、究相對落后,許多重要性狀的基因有待開發(fā)。分子標(biāo)記輔助育種技術(shù),是現(xiàn)在農(nóng)業(yè)技術(shù)發(fā)展的趨勢,而獲得優(yōu)良農(nóng)藝性狀的基因是這一技術(shù)的核心要求。一般來講現(xiàn)在獲得目標(biāo)基因主要采取圖位克隆的策略。圖位克隆目的基因一般由基因遺傳圖譜的構(gòu)建、物理圖譜的構(gòu)建、高通量精細圖譜的構(gòu)建、染色體登陸或步移、基因的鑒定五個要素組成。而這其中的關(guān)鍵技術(shù)染色體步移,需要大量的基因組DNA片段作為基礎(chǔ)。而BAC文庫正承擔(dān)了這一重要的角色。因此構(gòu)建谷子的分子生物學(xué)技術(shù)平臺就

3、顯得十分重要,而基因組文庫正是這一平臺的核心。豫谷一號是我國自主育成的優(yōu)良品種,在組織培養(yǎng)、遺傳學(xué)研究的三體構(gòu)建具有優(yōu)勢,美國的谷子基因組測序也采用豫谷1號,所以以其作為原始材料構(gòu)建BAC文庫有著十分重要的現(xiàn)實意義。 本研究參考了前人關(guān)于TAC文庫及BAC文庫的構(gòu)建方法,建立了自己的一套BAC文庫的構(gòu)建體系。包括:從幼嫩的葉片中獲得高分子量的DNA、大量最佳部分酶切條件的確定、片段大小的選擇、高效的連接與轉(zhuǎn)化體系等。最終獲得了一

4、套轉(zhuǎn)化效率高,重組率低,空載率低的BAC文庫構(gòu)建體系。由于BAC文庫的構(gòu)建相當(dāng)費時費力,其試驗的周期很長,且花費很大,因此每一步的試驗都要精益求精。在這一系列的步驟中第一步細胞核的提取及包埋最為關(guān)鍵的,它直接影響到后續(xù)工作的成敗。 利用所構(gòu)建的體系,以peBloBAC11為載體,構(gòu)建了豫谷一號的BAC文庫,到目前為止獲得了36096個克隆,并以單克隆的形式組裝保存。從所構(gòu)建的文庫中隨機挑取50個克隆用減裂解法提取質(zhì)粒,脈沖電泳進

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