苦蕎BAC文庫的構建及BAC末端序列分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、為了深入挖掘苦蕎的基因組信息,篩選與苦蕎品質相關的功能基因,以及為苦蕎全基因組測序提供幫助,以苦蕎品種“晉蕎麥2號”為材料,構建了苦蕎基因組BAC文庫、對部分克隆進行末端測序,對測序后比對得到的部分相關基因表達量進行分析。
  本研究主要內容包括:⑴參考Peterson等方法獲得高分子量的核基因組DNA,并成功構建了插入片段約123 kb,克隆數(shù)量為30000個的苦蕎基因組 BAC文庫,覆蓋苦蕎基因組約為6.9倍。⑵隨機選取48個

2、BAC克隆進行序列末端測序,得到89條BAC末端序列,通過序列比對分析發(fā)現(xiàn),有7條(8%)有比對結果。其中,有末端序列與rpoTm2、Trrap和MDR1等已知基因相似,這些基因與DNA錨定,物質跨膜運輸和磷酸轉移酶活性等功能有關。分析還發(fā)現(xiàn)末端序列40G19-F可能是苦蕎基因組的重復序列。對3個BAC全長序列進行對比發(fā)現(xiàn)與植物發(fā)育調控、種子發(fā)育和脯氨酸合成相關的基因,分別是homeobox、RIE1和TPRP-F1基因。⑶通過實時熒光

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