小鼠Prestin基因表達(dá)及啟動子轉(zhuǎn)錄活性分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究通過實(shí)時熒光定量PCR、基因克隆、雙熒光素酶報告實(shí)驗(yàn)等方法,研究了prestin基因在各組織中的表達(dá)和差異,對該基因不同轉(zhuǎn)錄變異體對應(yīng)的不同啟動子轉(zhuǎn)錄活性進(jìn)行了深入分析,并結(jié)合生物信息學(xué)的方法預(yù)測了相關(guān)順式調(diào)控元件和調(diào)控因子,獲得以下結(jié)果:
  (1)通過實(shí)時熒光定量對prestin基因在大腦、睪丸和耳蝸中總體表達(dá)量進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn)prestin除了在耳蝸中特異性高表達(dá)外,在小鼠睪丸和大腦中也有表達(dá)。隨后檢測了prestin基

2、因轉(zhuǎn)錄變異體1表達(dá)量,發(fā)現(xiàn)除了耳蝸外,大腦和睪丸中同樣存在著不同的轉(zhuǎn)錄變異體表達(dá),轉(zhuǎn)錄變異體1在耳蝸、大腦和睪丸組織中分別占總表達(dá)量的58.08%、43.77%、62.91%。
  (2)通過分析prestin基因已知的3種mRNA序列,針對不同轉(zhuǎn)錄變異體設(shè)計了特異性片段擴(kuò)增,定性的研究該基因不同轉(zhuǎn)錄變異體的表達(dá),發(fā)現(xiàn)耳蝸、大腦、睪丸、GC-1spg細(xì)胞中prestin基因均有轉(zhuǎn)錄本1的表達(dá),在耳蝸中也擴(kuò)增出轉(zhuǎn)錄變異體2或3。結(jié)合

3、5'RACE實(shí)驗(yàn)擴(kuò)增出睪丸中prestin基因mRNA的5'端序列,發(fā)現(xiàn)prestin基因在睪丸中表達(dá)轉(zhuǎn)錄變異體2或3,但沒有發(fā)現(xiàn)其他未知的轉(zhuǎn)錄變異體。
  (3)通過克隆prestin基因5'端DNA序列,構(gòu)建了啟動子1和啟動子2缺失片段載體,運(yùn)用雙螢光素酶報告系統(tǒng),檢測啟動子區(qū)轉(zhuǎn)錄活性變化規(guī)律,發(fā)現(xiàn)啟動子1在GC-1spg小鼠精原細(xì)胞中轉(zhuǎn)錄活性較低,而啟動子2的轉(zhuǎn)錄活性較高。第一外顯子上游-280bp到-765bp以內(nèi)存在轉(zhuǎn)錄

4、激活的轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件,-765bp到-1096bp內(nèi)存在轉(zhuǎn)錄抑制的調(diào)控元件,第二外顯子上游-952bp內(nèi)存在轉(zhuǎn)錄激活的調(diào)控元件,-952bp到-1954bp內(nèi)存在轉(zhuǎn)錄抑制的調(diào)控元件。
  (4)結(jié)合生物信息學(xué)分析預(yù)測了上述調(diào)控區(qū)潛在的大量轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子GATA-3,-2,-1潛在的結(jié)合位點(diǎn),結(jié)合已有報道,推測其可能在小鼠精原細(xì)胞中調(diào)控prestin基因的表達(dá)。
  本研究分析了prestin基因在耳蝸、睪丸

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