1、啟動(dòng)子是基因表達(dá)調(diào)控中非常重要的一類順式作用元件，它決定著基因轉(zhuǎn)錄的起始位置和轉(zhuǎn)錄頻率，因此啟動(dòng)子的研究對(duì)于闡釋基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的機(jī)制和基因組的功能都具有非常重要的意義。啟動(dòng)子的識(shí)別作為啟動(dòng)子研究的首要環(huán)節(jié)，正日益成為生物學(xué)研究的一個(gè)熱點(diǎn)。傳統(tǒng)啟動(dòng)子識(shí)別是通過免疫沉淀、突變分析等生物學(xué)實(shí)驗(yàn)來(lái)進(jìn)行的，這些方法成本高，效率低，極大地限制了啟動(dòng)子研究的進(jìn)展，因此利用計(jì)算機(jī)領(lǐng)域新興的數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)并開發(fā)相應(yīng)的軟件來(lái)進(jìn)行啟動(dòng)子預(yù)測(cè)已經(jīng)成為生物信息學(xué)

2、的一個(gè)重要方向。本文通過對(duì)啟動(dòng)子的序列特征進(jìn)行深入分析，利用隱馬爾科夫模型(簡(jiǎn)稱為HMM)進(jìn)行數(shù)學(xué)建模，設(shè)計(jì)并編碼實(shí)現(xiàn)了一個(gè)基于HMM的啟動(dòng)子預(yù)測(cè)軟件系統(tǒng)。
　　 本研究獲得了以下結(jié)果：
　　 1、設(shè)計(jì)并實(shí)現(xiàn)了一個(gè)基于HMM的啟動(dòng)子預(yù)測(cè)系統(tǒng)，包括序列輸入、預(yù)處理、模型訓(xùn)練、未知序列識(shí)別和結(jié)果輸出等部分。本系統(tǒng)能深入挖掘出啟動(dòng)子序列的內(nèi)部統(tǒng)計(jì)學(xué)規(guī)律，建立相應(yīng)的HMM，用于進(jìn)行啟動(dòng)子預(yù)測(cè)。
　　 2、用人類啟動(dòng)子序列