玉米轉(zhuǎn)錄因子Opaque2基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控與19-kDaα-醇溶蛋白基因的DNA甲基化研究.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、玉米(maize,Zea mays)是世界上最重要的糧食作物之一,玉米的籽粒是營(yíng)養(yǎng)儲(chǔ)藏的重要器官,在種子總蛋白中,種子儲(chǔ)藏蛋白(seed storage proteins,SSP)約占總蛋白含量的70%,其中的醇溶蛋白又是玉米種子儲(chǔ)藏蛋白中最重要的蛋白,約占70%。然而由于醇溶蛋白特別是α-醇溶蛋白的必需氨基酸含量較低,影響了玉米的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值。而轉(zhuǎn)錄因子Opaque2(O2)能結(jié)合22-kDa的α-醇溶蛋白基因啟動(dòng)子上的TCCACGTAG

2、A模體序列調(diào)控其表達(dá),O2基因的突變能降低α-醇溶蛋白的含量,提高含必需氨基酸蛋白的含量,從而提高玉米的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值。此外,O2還能通過(guò)結(jié)合核糖體失活蛋白(Ribosome-Inactivating Proteins,RIP)基因啟動(dòng)子上的GATGAPyPuTGPu模體調(diào)控其表達(dá)。本研究利用生物信息學(xué)的方法,在玉米全基因組范圍內(nèi)搜索潛在的O2所調(diào)控基因;結(jié)合雙向電泳及質(zhì)譜技術(shù),分析W64A及其O2突變體W64Ao2的差異蛋白,尋找O2基因所

3、調(diào)控的蛋白;并對(duì)19-kDa的α-醇溶蛋白基因啟動(dòng)子及其本體的DNA甲基化進(jìn)行分析,探究19-kDa和22-kDa的α-醇溶蛋白基因的表達(dá)調(diào)控機(jī)制,主要研究結(jié)果如下:
  1、在玉米全基因組范圍內(nèi)搜索到31個(gè)啟動(dòng)子上含TCCACGTAGA模體的基因,其中有8個(gè)是串聯(lián)重復(fù)的22-kDa的α-醇溶蛋白基因。GO分析顯示這8個(gè)α-醇溶蛋白基因參與營(yíng)養(yǎng)儲(chǔ)藏功能,其他基因主要是參與催化活性的酶類編碼基因。而含有GATGAPyPuTGPu模體

4、序列的基因有683個(gè),其中197個(gè)基因有功能注釋,GO分析顯示這些基因參與最多的是結(jié)合、催化活性和細(xì)胞組分,并且多數(shù)參與核酸、蛋白質(zhì)、氨基酸及糖類等物質(zhì)的代謝催化反應(yīng),另外還有部分轉(zhuǎn)錄因子。組織表達(dá)分析顯示共有12個(gè)基因在胚乳中特異性表達(dá),其中8個(gè)是22-kDa的α-醇溶蛋白基因,另外4個(gè)是含有GATGAPyPuTGPu模體序列的基因,其中包括直接受O2調(diào)控的RIP基因。
  2、通過(guò)雙向電泳和質(zhì)譜技術(shù)共鑒定到W64A及其O2突變

5、體間的19個(gè)差異蛋白,GO分析發(fā)現(xiàn)這些蛋白主要是參與催化和代謝相關(guān)酶類,以及參與細(xì)胞組成和應(yīng)激相關(guān)。組織表達(dá)分析表明6個(gè)為種子中特異性高表達(dá)的蛋白,分別是與種子儲(chǔ)藏相關(guān)的蛋白、蛋白二硫鍵異構(gòu)酶(protein disulfide isomerase,PDI)和直接受O2基因調(diào)控的RIP蛋白。通過(guò)RT-PCR實(shí)驗(yàn)檢測(cè),發(fā)現(xiàn)有5個(gè)基因在野生型與突變體中的轉(zhuǎn)錄水平差異較大。
  3、對(duì)19-kDa的α-醇溶蛋白基因啟動(dòng)子的DNA甲基化分

6、析發(fā)現(xiàn)啟動(dòng)子的高甲基化能抑制醇溶蛋白基因的表達(dá),而組織培養(yǎng)能改變基因啟動(dòng)子上的DNA甲基化狀態(tài),從而改變基因的表達(dá)水平,而且組織培養(yǎng)對(duì)不同基因的DNA甲基化的影響不同,既能降低又能升高DNA甲基化水平。在z1B基因中,z1B1的啟動(dòng)子DNA甲基化水平降低而使其表達(dá)水平顯著上升,而z1B4和z1B6的啟動(dòng)子DNA甲基化水平升高而使其表達(dá)水平顯著下降。但z1A基因啟動(dòng)子DNA甲基化的變化對(duì)基因的表達(dá)幾乎沒(méi)有影響,表現(xiàn)出位點(diǎn)特異性。相比啟動(dòng)子

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