參與調節(jié)AM真菌共生的關鍵ZmPIN基因篩選及功能分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、玉米(Zea mays)作為重要的經(jīng)濟作物之一,其生長和發(fā)育受到環(huán)境中生物和非生物逆境因子的脅迫,嚴重地制約玉米的產(chǎn)量和品質。叢枝菌根(Arbuscular mycorrhizal,AM)真菌可與玉米形成的共生體,不僅能提高宿主從土壤中吸收大量的營養(yǎng)元素和水分,還能增強植株的抗逆性。前期發(fā)現(xiàn),AM真菌可顯著促進玉米側根的生長,這可能由于AM真菌侵染改變植物根部生長素的重新分布從而誘導側根的增多,然而,其調節(jié)機制仍需進一步分析。至此,本研

2、究以AM真菌(Glomus versiforme)和玉米共生體為研究對象,通過AM真菌侵染后的玉米轉錄組分析結果,解析調控的關鍵調控網(wǎng)絡,利用玉米PIN基因家族的生物信息和誘導表達模式分析,發(fā)掘調節(jié)玉米根系生長素重新分布的關鍵PIN基因,并通過體外百脈根毛根體系和水稻穩(wěn)定轉化驗證該基因在調節(jié)生長素分布及側根生長中的作用。主要結果如下:
  1.選取AM真菌侵染30天后的玉米側根,以未處理的根作為對照進行轉錄組分析,結果分析表明,7

3、1%以上序列可以mapping到玉米參考基因組上,23997個基因的表達量顯著上調,3721個基因的表達量被下調。GO富集分析可知,差異表達基因主要參與調控ATP、DNA和金屬離子結合相關。KEGG Pathway分析發(fā)現(xiàn)差異表達的基因主要分布在代謝通路,其次為植物激素信號通路和植物真菌互作通路。
  2.依據(jù)PIN基因家族的Mem trans結構域特征,篩選玉米全基因組,發(fā)現(xiàn)14個玉米PIN同源基因,可以將其分為三個亞家族。熱圖

4、表達分析發(fā)現(xiàn),ZmPIN5b和ZmPIN10b基因在任何組織中都不表達,而ZmPINY基因在所有組織中均表達。在玉米主根中均有表達的基因有ZmPIN1a-1d、ZmPIN8、ZmPIN10a、ZmPINY,尤其ZmPIN1a、ZmPIN1b基因在根中具有較高的表達水平。
  3.利用RT-qPCR分析ZmPIN家族基因在AM真菌侵染后的表達模式,發(fā)現(xiàn)ZmPIN5c、ZmPIN10b、ZmPINX在二者共生30d后表達開始上調,而Z

5、mPIN5c和ZmPINX基因在共生整個過程均表現(xiàn)上調趨勢,ZmPIN10b基因僅在誘導初期具有較高的表達水平;與此相反地,ZmPIN1a、ZmPIN1c、ZmPIN9基因的表達量在AM真菌侵染前后基本不改變;ZmPIN1b、ZmPIN1d、ZmPIN2、ZmPINY基因在共生早期階段表達量均下降,但在后期表達量上升。
  4.根據(jù)誘導表達分析結果,選取ZmPIN1a,ZmPIN5c,ZmPINY三個PIN家族基因,構建過表達(3

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