1、番木瓜環(huán)斑病毒(Papayaringspotvirus,PRSV)是馬鈴薯Y病毒屬的典型成員，是番木瓜病害中的主要病原，造成世界番木瓜生產(chǎn)上的主要損失。PRSV是由單一ORF編碼的，多聚蛋白表達(dá)后再分解成各個(gè)功能蛋白。本文對(duì)采自福建農(nóng)林大學(xué)校區(qū)的被PRSV感染的番木瓜病葉樣本進(jìn)行研究。對(duì)PRSV中的HC-Pro、NIb和CP編碼基因進(jìn)行擴(kuò)增克隆、原核表達(dá)、GST融合蛋白抗體制備和系統(tǒng)進(jìn)化分析及基本生物信息學(xué)分析。 通過(guò)Trizo

2、l法提取PRSV的總RNA。根據(jù)臺(tái)灣的YK分離物、美國(guó)夏威夷的HA分離物、墨西哥分離物、泰國(guó)分離物的基因組全長(zhǎng)中的較保守序列區(qū)域分別設(shè)計(jì)引物，通過(guò)RT-PCR方法擴(kuò)增出特異性目的條帶。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)回收、連接、轉(zhuǎn)化DH5α大腸桿菌克隆至pMD18-T載體上，經(jīng)藍(lán)白斑和氨芐青霉素抗性篩選和雙酶切法鑒定，分別獲得了重組質(zhì)粒pMD-HC、pMD-NIb和pMD-CP。再經(jīng)過(guò)雙酶切，把目的基因連接到表達(dá)載體pGEX-4T-1上，分別獲得了pG

3、EX-4T-HC、pGEX-4T-NIb和pGEX-4T-CP重組表達(dá)質(zhì)粒，并對(duì)它們進(jìn)行了序列測(cè)定和分析。經(jīng)過(guò)BLAST程序比對(duì)，HC-Pro的核苷酸序列與臺(tái)灣的YK分離物(X97251)的HC-Pro在核苷酸水平上同源性最高，達(dá)到90.63％，在氨基酸水平上與泰國(guó)的PRSV-P株系(AAO16605)同源性為97.82％。NIb的核苷酸和序列與中國(guó)華南SM分離物(X96538S76059)同源性最高，達(dá)到90％，在氨基酸水平上與泰國(guó)的

4、PRSV-W株系(AAG47346)同源性最高，達(dá)到95％。CP基因的核苷酸序列與一個(gè)登錄號(hào)為D50591的日本分離物同源性最高，達(dá)到95％。在氨基酸水平上與一個(gè)登錄號(hào)為PAA016605泰國(guó)的泰國(guó)分離物同源性最高，達(dá)到93％。另外，在CP、NIb和CP蛋白的氨基酸水平上構(gòu)建了系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)，結(jié)果表明我國(guó)福建本地的PRSV與泰國(guó)分離物的PRSV的親緣關(guān)系較近。 本文利用pGEX-4T-1的GST標(biāo)簽進(jìn)行目的蛋白的融合表達(dá)，分別構(gòu)建了