1、甜瓜DNA指紋圖譜庫的建立對甜瓜品種純度及真實性鑒定、新品種權保護等有非常重要應用價值，甜瓜遺傳多樣性的分析對雜種優(yōu)勢群劃分、種質創(chuàng)新及新品種選育也有非常重要的指導意義。SSR標記被認為是指紋圖譜構建最理想的標記。本研究利用SSR標記對PCR擴增反應體系進行了優(yōu)化，初次探討了多重SSR-PCR擴增體系在甜瓜上的可行性，旨在提高鑒定效率及節(jié)省時間。在此基礎上，利用13份遺傳差異大的甜瓜種質進行核心引物的篩選，并通過核心引物對甜瓜種質進行指

2、紋圖譜構建、遺傳多樣性分析以及對甜瓜雜交組合進行純度鑒定，主要研究結果如下：
　　1.對PCR擴增體系中的模板DNA、dNTPs、引物、Taq酶及Mg2+的濃度進行梯度設計，得到了最優(yōu)PCR擴增體系，同時建立了適用于甜瓜的雙重SSR-PCR擴增體系，使得SSR檢測效率提高了2倍，節(jié)省了成本。
　　2.從174對SSR引物中篩選了22對核心引物，在13個甜瓜種質中共擴增了77個多態(tài)性位點，每對引物可以檢測到2～4條數(shù)目不等的多

3、態(tài)性條帶，平均為3.5條，多態(tài)性信息含量(PIC)為0.737～0.839，平均0.806，22對引物中有18對分布在甜瓜的10對染色體上。
　　3.利用22對核心引物構建了52份甜瓜種質的指紋代碼，并將其全部轉化為二維編碼，其中有7組具有相同指紋代碼的材料，總共涉及23份材料，其余29份甜瓜種質的指紋代碼是唯一的。
　　4.基于20個形態(tài)性狀的聚類分析結果顯示，遺傳相似系數(shù)為0.07～0.72，平均為0.39，遺傳相似系數(shù)

4、大于0.07時，所有甜瓜種質可劃分為9大組群，且組群Ⅰ至組群Ⅳ的多樣性偏低，組群Ⅴ至組群Ⅸ的甜瓜種質遺傳多樣性依次增高。
　　5.基于22對核心引物聚類分析結果顯示，遺傳相似相系數(shù)在0.55～1.00，平均為0.78。當遺傳相似系數(shù)大于0.55時可將95份甜瓜種質分為薄皮甜瓜和厚皮甜瓜兩大類，同時這兩大類又可按不同變種分為不同的亞類。
　　6.用74對SSR引物對16個甜瓜組合進行篩選，獲得了10對表現(xiàn)出多態(tài)性和共顯性的引物