黃鯽分子標(biāo)記開發(fā)及遺傳多樣性分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、黃鯽(Setipinna taty),俗名麻口前、毛口國、黃鰶、雞毛鰳,隸屬于脊索動物門,硬骨魚綱,鯡形目(Clupeiformes),鳀科(Engraulidae),黃鯽屬(Setipinna);常棲息于淤泥底質(zhì)、水流較緩的海區(qū),白天棲息的水層較深,夜晚上浮表層;主要分布于印度洋、太平洋西部,在我國的主要分布海域為東海、黃海、渤海。
  黃鯽是東海區(qū)春冬季海洋漁業(yè)的主要捕撈對象,其漁獲量及比例不可忽視,隨著捕撈強度的增大,不少地

2、區(qū)開始重視對黃鯽漁業(yè)資源的開發(fā)利用,為了準(zhǔn)確評估黃鯽的種質(zhì)資源現(xiàn)狀,我們需要對黃鯽的種質(zhì)資源進行具體調(diào)查和分析。
  本研究開發(fā)了11個黃鯽特異的多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記,根據(jù)已經(jīng)開發(fā)的微衛(wèi)星標(biāo)記分析黃鯽遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性水平。我們還獲得黃鯽線粒體基因組全序列,解析其線粒體基因組中編碼序列和非編碼序列的結(jié)構(gòu)和特征;基于黃鯽和鯡形目下的12種魚類的線粒體基因組全長,構(gòu)建鯡形目魚類的分子系統(tǒng)發(fā)育樹。這些研究為黃鯽的種質(zhì)資源評估,分子輔助育種

3、等研究提供了候選標(biāo)記。
  本研究主要結(jié)果如下:
  1.微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)和多態(tài)篩選:本研究利用FIASCO法構(gòu)建(CA)13黃鯽微衛(wèi)星 DNA富集文庫,克隆測序,獲得38個含有微衛(wèi)星位點的序列,設(shè)計38對引物,經(jīng)過篩選優(yōu)化獲得11個具有黃鯽特異的多態(tài)性的微衛(wèi)星標(biāo)記。為黃鯽的種質(zhì)資源評估、分子輔助育種等研究提供了候選標(biāo)記。
  2.群體遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)的分析:利用黃鯽11個多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記分析東海海域舟山、象山、寧

4、海,及黃海海域煙臺、威海這5個群體的遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性水平。結(jié)果顯示,11個多態(tài)位點平均等位基因為4.84,觀測雜合度和期望雜合度分別在0.3500~0.8421和0.5244~0.6244之間,表明11個微衛(wèi)星位點具有較高的雜合度,群體保持著豐富的遺傳多樣性。煙臺和舟山兩個群體的親緣關(guān)系最遠;煙臺和威海兩個群體的親緣關(guān)系最近。
  3.線粒體基因結(jié)構(gòu)和排列順序的分析:黃鯽線粒體基因組全序列在基因排列順序、內(nèi)部結(jié)構(gòu)等,均類似于其

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