豬GPD1基因表達與轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩102頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權,請進行舉報或認領

文檔簡介

1、細胞質(zhì)甘油磷酸脫氫酶(GPD1,EC1.1.1.8)以NAD+作為電子的供體,催化磷酸二羥丙酮到3-磷酸甘油之間的氧化還原轉(zhuǎn)化反應。該反應在細胞質(zhì)中完成,爾后3-磷酸甘油透過線粒體膜,在線粒體中甘油磷酸脫氫酶的作用下,將還原力傳給FAD同時重新生成磷酸二羥丙酮,后者再透過線粒體膜返回到細胞質(zhì)中。這個循環(huán)稱為3-甘油磷酸穿梭。同時,磷酸二羥丙酮是糖酵解的中間產(chǎn)物,3-磷酸甘油還參與了脂類的從頭合成,在沒有甘油激酶的組織圖肌肉中,GPDI所

2、催化的氧化還原反應是3-磷酸甘油的主要來源。因此,細胞質(zhì)甘油磷酸脫氫酶既參與了跨線粒體膜的電子傳遞,同時還處于糖脂代謝的連接點位置,在機體能量代謝中發(fā)揮著重要的作用。本實驗以人類同源的GPD1基因為模板,設計引物分離了豬GPD1基因的全基因組序列,在此基礎上又進行了該基因組織表達譜分析、染色體定位、亞細胞定位、啟動子表達調(diào)控分析及GPDI蛋白三級結(jié)構的預測,結(jié)果如下:
   (1)首次獲得了豬GPD1基因的全基因組序列,包括5’

3、和3’非翻譯區(qū)以及外顯子與內(nèi)含子部分。豬GPD1基因包括8個外顯子和7個內(nèi)含子,全長約9.3kb。其中啟動子區(qū)長約3.3kb: CDS長l050bp,編碼349個氨基酸。豬CDS序列在不同的物種中有較高的相似性,和牛有99%的相似性,和人與小鼠的相似性分別達到了90%和89%。用17個真核物種的CDS序列和MEGA4.1的N-J方法構建了系統(tǒng)進化樹,顯示豬和牛有較近的遺傳距離。
   (2)利用輻射雜種克隆板將豬GPD1基因定位

4、在5號染色體上。進一步的分析把該基因定位于SW2425和GAMMMA分子標記中間,而這個區(qū)間內(nèi)有平均背膘厚、日增重、40和60千克背膘厚等的QTL。而亞細胞定位研究結(jié)果表明,豬GPD1蛋白位于細胞質(zhì)中,這和其功能是一致的。
   (3)相對實時熒光定量RT-PCR結(jié)果表明,豬GPD1基因Mrna是廣譜表達的,在所檢測的13個組織中都有表達,但是各組織間表達量相差很大,達到兩個數(shù)量級。腸系脂肪、皮下脂肪和十二指腸有較高的表達量,肝

5、臟、腎臟、大腦等中等表達量,而心臟、胰臟等組織的表達量較低。
   (4)對從出生到斷奶(21天)后l周仔豬背肌和大腦組織中不同時間點Mrna表達量檢測結(jié)果表明,在背肌和大腦中GPDI基因的時間序列表達譜具有相似的模式。豬GPD1基因在胚胎時間開始表達,背肌中的表達在出生后第8天達到最高,而在大腦中則是第14天達到頂峰。斷奶能顯著降低該基因的表達,隨后表達量又慢慢地回復到斷奶前的水平并略微有所提高,但不顯著。
   (5

6、)基于Interproscan程序,對豬GPDI蛋白功能進行初步的預測,豬GPD1基因有兩個明顯的結(jié)構域,C末端的催化結(jié)構域和N末端的結(jié)合結(jié)構域。通過基于馬爾代夫模型的swiss-model對該蛋白的三級結(jié)構進行預測,顯示該蛋白含有8個B折疊和15個a螺旋,同時含有一個保守的底物結(jié)合基序(10-GSGNWO-15)。
   (6)啟動子結(jié)構分析表明,豬GPD1基因啟動子和人類有較高的相似性,和人類GPD1基因啟動子相比,有三段高

7、度保守的區(qū)域和一段缺失片段。就結(jié)構而言,豬GPDI基因啟動子的5’末端有一個HindⅢ限制性酶切位點,一個遠端啟動子和兩個脂肪特異性元件,并且和上游的基因有約500bp的重疊區(qū)域。
   (7)啟動子活性預測分析表明,和上游重疊的區(qū)域?qū)幼拥幕钚杂幸欢ǖ拇龠M作用。在-1187和-851之間有一個明顯的負調(diào)控元件。而在-502到-423之間有一個轉(zhuǎn)錄促進元件,這段的缺失使啟動子活性大大降低。轉(zhuǎn)錄因子C/EBPB在豬GPD1啟動子

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權或不適當內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論