先天性心臟病家系收集及其GATA-6基因突變的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:先天性心臟病(Congenital Heart disease,CHD,簡稱先心病)是一類常見的危害嬰幼兒健康的先天畸形,其發(fā)病率為活產(chǎn)嬰兒的6‰-8‰,每年中國有15 萬以上先心病患兒出生,居出生缺陷發(fā)生率和死亡率之首,我國每年用于先心病的手術(shù)費(fèi)用約120 億人民幣。因此,先心病不僅是一個公共衛(wèi)生問題,而且已成為一個嚴(yán)重影響國民經(jīng)濟(jì)發(fā)展和人民日常生活的社會問題。目前,遺傳因素在先心病發(fā)生機(jī)制中的作用日益成為國內(nèi)外研究的熱點(diǎn),但對

2、具體的遺傳因素及其作用機(jī)制認(rèn)識甚少。通過先心病家系資料和生物標(biāo)本的收集、保存,對先心病遺傳學(xué)機(jī)制研究十分重要。研究顯示,目前已知的與人類先心病發(fā)生相關(guān)的致病基因如TBX5、NKX2.5、GATA-4 均是首先通過先心病家系的基因檢測研究證實(shí)。近年來隨著人類基因組計(jì)劃的順利完成,研究人類疾病的方法和技術(shù)手段迅速發(fā)展,通過基因組分析技術(shù)不僅能直接探索研究特定家系的病因,還可以識別心臟發(fā)育缺陷相關(guān)的易感基因或揭示基因新的功能,這將為散發(fā)先心病

3、致病基因分析指明方向。利用我們擁有獲得來自全國各地先心病患兒資料的優(yōu)勢,進(jìn)行先心病家系的收集,將為探索先心病發(fā)生機(jī)制提供有利保障。近十年來隨著分子生物學(xué)和分子遺傳學(xué)技術(shù)的進(jìn)展,人們對心臟發(fā)育的過程及其機(jī)制有了更深入的了解,心臟發(fā)育不僅涉及不同時間、不同空間若干基因的先后表達(dá),也涉及這些基因間復(fù)雜而精確的相互作用,其中任何一個基因表達(dá)質(zhì)或量的異常都可能會影響心臟發(fā)育而導(dǎo)致先心病。當(dāng)今心臟特異性轉(zhuǎn)錄因子成為研究熱點(diǎn),大量實(shí)驗(yàn)研究發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子

4、GATA-4、TBX5、ZIC3、NKX2.5、TFAP2B、TBX1 和 FOG2 與先心病發(fā)生密切相關(guān)。同屬GATA 家族的轉(zhuǎn)錄因子GATA-6 與GATA-4 重疊表達(dá)在心臟的發(fā)育,是近年來新發(fā)現(xiàn)的在心臟發(fā)育過程中起重要作用的一個基因。人類GATA-6基因位于染色體18q11.1~q11.2,全長34812bp,包括7個外顯子,編碼595 個氨基酸。通過動物研究證實(shí),轉(zhuǎn)錄因子GATA-6 為心臟前體細(xì)胞的早期標(biāo)志之一,是目前參與先

5、心病發(fā)病機(jī)制中的主要候選基因之一,GATA-6 基因敲除小鼠導(dǎo)致小鼠胚胎死亡,而使GATA-6 基因部分性失活會導(dǎo)致心臟流出道畸形。由于人類先心病與GATA-6基因異常之間的關(guān)系研究非常有限,為此本課題對收集的先心病家系患者及散發(fā)心臟圓錐動脈干畸形患者進(jìn)行GATA-6 基因突變檢查研究,觀察GATA-6 基因突變與先心病發(fā)病的相關(guān)性,進(jìn)一步探討先心病患者與GATA-6 基因突變情況以及基因型和表現(xiàn)型之間的關(guān)系,為闡述先心病的分子遺傳學(xué)機(jī)

6、制提供有價值的資料。本研究分為兩個部分:
   第一部分:先天性心臟病家系收集。
   方法:2009年7月-2011年1月在上海兒童醫(yī)學(xué)中心和新華醫(yī)院就診的的先天性心臟病患兒及其親屬,凡一個家系中有2個及2個以上先天性心臟病患者的均作為研究對象,詳細(xì)詢問先天性心臟病家族史及致病因素問卷調(diào)查,對確診的先天性心臟病家系進(jìn)行分析。
   結(jié)果:發(fā)現(xiàn)25個先天性心臟病家系,共有57 人患先天性心臟病。一級親屬患病率為4

7、3.0%(46/107)明顯高于二級親屬患病率4.4%(11/252)(χ 2 =83.897,P <0.01),雙胎患病率為90%,同胞患病率為62.2%,二者患病率比較,有顯著性差異(χ 2 =4.983,P <0.05)。Emery AEH 分離分析法對家系先心病遺傳方式進(jìn)行分析,結(jié)果符合常染色體單基因顯性遺傳,因同胞數(shù)不符合自然狀態(tài),故不能肯定其常染色體顯性遺傳方式。25 個家系中一級親屬心臟表型一致的有11 個家系(44%),

8、病種分別為室間隔缺損6 個家系、房間隔缺損2 個家系、圓錐動脈干畸形2 個家系、左室發(fā)育不良綜合征1個家系;發(fā)現(xiàn)10個雙胎家系,同時患先天性心臟病同卵雙胎有8 個家系,心臟表型一致的有3 個家系(37.5%);先證者與一、二級親屬先天性心臟表型不完全一致。致病因素問卷調(diào)查中發(fā)現(xiàn)先心病家系中母親孕早期先兆流產(chǎn)史的發(fā)生率高于散發(fā)性先心病,二者比較有顯著差異(χ 2 =8.704,P <0.05)。
   結(jié)論:先天性心臟病具有家族聚

9、集現(xiàn)象,親屬發(fā)病率高低與血緣關(guān)系遠(yuǎn)近顯著相關(guān),血緣關(guān)系越近,患病率越高;雙胎在此次家系調(diào)查中的比率占40%,其患病率高于同胞患病率;先證者與一、二級親屬間心臟表型不完全一致;家系中先兆流產(chǎn)史的發(fā)生率高于散發(fā)先天性心臟病,推測先兆流產(chǎn)的發(fā)生可能主要受遺傳因素的影響;通過先天性心臟病家系收集、調(diào)查,為探索遺傳學(xué)機(jī)制提供有利條件;因家系調(diào)查的局限性,同胞數(shù)不符合自然狀態(tài),將為遺傳流行病學(xué)研究帶來新的問題和挑戰(zhàn)。
   第二部分:先天性

10、心臟病患者與GATA-6 基因突變的研究。
   方法:選擇43例先心病家系患者、148例單純性圓錐動脈干畸形患者以及 300 例健康者,應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase chain reaction ,PCR )方法擴(kuò)增 GATA-6 基因7 個外顯子編碼區(qū)及兩側(cè)部分內(nèi)含子區(qū),PCR 產(chǎn)物純化后ABI Genetic Analyzer3100 型DNA 測序儀自動測序,然后與NCBI 數(shù)據(jù)庫中GATA-6 基因的序列進(jìn)行

11、比對,并與健康對照組比較,觀察 GATA-6 基因突變情況。
   結(jié)果:GATA-6 基因在先心病中突變率為1.05%(2/191),均為法洛四聯(lián)癥患兒。發(fā)現(xiàn)的兩個雜合子突變均為錯義突變,分別位于第 2 號外顯子Glu51Lys,此位點(diǎn)突變?yōu)閲H上首次報道;位于第 2 號外顯子的Ser 184 Asn(曾被報道)。識別GATA-6基因8 個SNP 。新發(fā)現(xiàn)SNP2 個,分別為第6 內(nèi)含子剪接位點(diǎn)+6 位堿基改變,即c.1658

12、9+6T>C 和第2 內(nèi)含子c.10501-85T>C;6 個SNP 分別為第2 號外顯子Gly15Arg,即rs116262672,非編碼區(qū):rs76308670 、rs116262672 、rs3764962 、rs1941084 、rs1941083,與NCBI 的SNP 數(shù)據(jù)庫中報道的完全一致。
   結(jié)論:轉(zhuǎn)錄因子GATA-6 基因突變可能與先天性心臟病發(fā)生有關(guān);轉(zhuǎn)錄因子GATA-6基因可能是人類單純性心臟圓錐動脈干畸

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