玉米類胡蘿卜素合成相關(guān)基因的標(biāo)記定位與序列多態(tài)性分析.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩57頁未讀, 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡介

1、類胡蘿卜素是生物體內(nèi)通過類異戊二烯途徑合成的一類黃色或紅橙色的色素,主要存在于植物葉片的葉綠體以及花和果實(shí)的有色體中。類胡蘿卜素中的β-胡蘿卜素和含β-環(huán)的胡蘿卜素是人類及動(dòng)物體內(nèi)維生素A合成的前體,而維生素A具有防止夜盲癥和視力衰退、促進(jìn)生長發(fā)育及增強(qiáng)免疫力等生理功能。目前,維生素A的缺乏己涉及到世界上70多個(gè)國家,而玉米是重要的糧食作物和飼料作物,因此,增加玉米中類胡蘿卜素的含量具有重要的意義。 PSY1、PDS和ZDS是玉

2、米類胡蘿卜素生物合成途徑中的3個(gè)關(guān)鍵酶基因,本研究利用本實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)構(gòu)建的包含294個(gè)家系的玉米R(shí)IL群體,通過發(fā)展STS標(biāo)記和SNP標(biāo)記來定位玉米類胡蘿卜素合成相關(guān)的基因;利用PSY1、PSY2、PDS和ZDS基因在玉米及其近緣野生種(薏苡、大芻草和摩擦禾)中的序列,研究這些材料之間的進(jìn)化關(guān)系。主要研究結(jié)果如下: 1.通過特異引物設(shè)計(jì)和退火溫度選擇,把單核苷酸多態(tài)性轉(zhuǎn)變?yōu)殚L度多態(tài)性,發(fā)展了一種基于PCR快速檢測SNP的方法,簡稱

3、AC-PCR。該方法可應(yīng)用于基因定位和SNP檢測等領(lǐng)域。 2.利用STS標(biāo)記將PSY1的假基因PSY2基因定位于玉米第8染色體8.07Bin,與標(biāo)記bnlg1823和umc1268的遺傳距離分別為1.1cM和2.7cM;PDS基因定位于第1染色體的1.01Bin和1.02Bin之間,與標(biāo)記phi42791和bnlg1614的遺傳距離分別為6.6cM和2.9cM。通過AC-PCR的方法將ZDS基因定位于第7染色體7.01Bin和7

4、.02Bin之間,與標(biāo)記phi057和umc1016的遺傳距離分別為10.8cM和2.4cM。 3.通過PSY1、PSY2、PDS和ZDS基因在40份玉米、5份薏苡、7份大芻草、1份摩擦禾及2份水稻中的部分序列信息,分別構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果暗示墨西哥玉米亞種或小穎玉米亞種可能是玉米的直接祖先。PSY2是PSY1的假基因,其功能的喪失可能發(fā)生在薏苡與玉米分化之后,大芻草與玉米分化之前。以玉米序列為基礎(chǔ),推測玉米與其近緣種由近及遠(yuǎn)

5、的親緣關(guān)系可能是墨西哥玉米亞種和小穎玉米亞種,繁茂玉米種和二倍體多年生玉米種,摩擦禾,薏苡和水稻,初步明確了薏苡在玉米遺傳進(jìn)化中的位置。 4.玉米核苷酸的多態(tài)性很高,PSY1、PSY2、PDS和ZDS四個(gè)基因平均每34bp發(fā)生一個(gè)核苷酸突變。PSY1中白色玉米的核苷酸多態(tài)性明顯高于黃色玉米,在PSY2、PDS和ZDS三個(gè)基因中白色玉米的核苷酸多態(tài)性與黃色玉米的相差不大。在PSY1、PSY2、PDS和ZDS四個(gè)基因中,普通玉米群體

6、的多態(tài)性均高于高油玉米群體。四個(gè)基因中沉默位點(diǎn)的Pi值或θ值均高于非同義位點(diǎn)的Pi值或θ值。 5.對PSY1、PSY2、PDS和ZDS四個(gè)基因進(jìn)行Tajima'sD測驗(yàn)和HKA測驗(yàn)表明,僅PSY1基因在黃色玉米群體中受到顯著的選擇,而在總的玉米材料或白色玉米材料中不受選擇,PSY2、PDS和ZDS三個(gè)基因在不同群體中均不受選擇。 6.PSY1、PSY2、PDS和ZDS四個(gè)基因的連鎖不平衡分析表明,PSY1基因的衰退距離在

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論